华佗在《三国志》和《后汉书》中都有传，甚至他还有别传，当然在这些传记中的主要内容都是他在汉末“医学界”的种种传奇故事，涉及他死因的内容就只有动机、罪行两方面。
电影《华佗与曹操》
动机曹操中年时就患有“头风”，在听闻老乡华佗的医术高超之后，就请华佗担任自己的私人医生，华佗的针灸技术可以缓解曹操的头痛。
曹操对华佗也非常信任，其心理无非两点：第一，华佗医术高超，第二，乡党情怀。
太祖闻而召佗，佗常在左右。太祖苦头风，每发，心乱目眩，佗针鬲，隨手而差。所以华佗倘若老老实实只做曹操的私人医生，没有二心，平平淡淡活到老根本就不是个问题。比如汉末的太医令脂习，这位当时的“医学界大佬”就知道曹操的厉害，靠着低调做人，活到了魏文帝时期，曹丕还给他赏赐，可谓荣誉之至。他也活到八十多岁，寿终正寝。
偏偏华佗本人不这么想，他认为自己出身士人，应该走士人的出仕路线，比如举孝廉，出镇地方，入为内侍这种。其实华佗真的高估自己了。
电视剧《三国演义》中的华佗与曹操
同样的另一位曹操乡党：许褚。人家从来不说自己做曹老板保镖没前途，不风光之类的，人家一做就是几十年，出生入死，后来还入了太祖庙。
陈寿在《三国志·华佗传》中说华佗“然本作士人，以医见业，意常自悔”，就是这种情况；范晔不知道看了什么书，在《后汉书·华佗传》中甚至贬低华佗“为人性恶难得意”，这就是说华佗“欲壑难填”了。
华佗的动机大致如此，所以他根本不满意在曹操手下当私人医生，总想着“曹老板”能突然对自己重视起来，提拔自己走上人生巅峰。
罪行在“曹老板”长期没能理解华佗真实想法，华佗也没有机会向“曹老板”吐露真实心声这样的尴尬局面下，华佗选择了一种水平低下的方法来表达诉求：“说谎请假”，他自认为这方法可以自抬身价，让“曹老板”在头痛的时候能深刻体会到自己的重要性。
他这种方法，其实就在汉末士人中普遍流行的养名方法，只不过别人都是说自己生病了，可能华佗考虑到自己是名医的身份，这个借口太讽刺，于是就借口说自己妻子生病了，自己要留下来给妻子看病。——想想这个借口还是蛮强的。
华佗画像
其实曹操也是通达人情世故之人，知道“称病不就”这种段子在前辈故事中发生了太多太多次了，多少是有“自抬身价”的意思，所以曹操亲自写信给华佗，又让地方政府出面说情，已经给足了华佗的面子，华佗却仍然不肯放下架子。——曹操在面子给到位之后，发现华佗仍然不识抬举，曹操这才决定要清算华佗。
《三国志·华佗传》中说：太祖大怒，使人往检。若妻信病，赐小豆四十斛，宽假限日；若其虚诈，便收送之。只可惜，他妻子不比司马懿的妻子张春华，司马懿装病被婢女发现了，张春华可以杀婢女来替丈夫保守秘密，华佗说自己妻子病了，他妻子却不能配合他。
曹操派人这么一查，华佗的谎言就被拆穿了。于是被送入监狱。
当时的尚书令荀彧还为华佗求情，结果曹操来一句：佗能愈此，小人养吾病，欲以自重，然吾不杀此子，亦终当不为我断此根原耳。
虽然我们大多数人都认为华佗是真的不能根治曹操的头风病，但是按照华佗的行为记载来看，曹操说华佗“养病自重”也算是说中了。
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