作为我国最后一个大一统的封建帝国，清朝的建立是一个非常“励志”的过程，从努尔哈赤13副盔甲起兵，到顺治入关、康熙统一全国，绝对是史诗级的过程。清朝能够发家，“八旗制度”发挥了重要的作用。然而早期努尔哈赤建旗时，只设立了正黄、正红、正白和正蓝四旗，而镶黄、镶红、镶白和镶蓝四旗是时隔15年之后才增设的。明万历四十三年（1615年），八旗之制正式确立。
在这八旗之中，如果单从颜色上来区分，两黄旗无疑是最尊贵的。在中原文化中，黄色在天地五行中属土，这种“土”是在宇宙中央的“中央土”，为五行之尊。这种道家提出的理论后来又被儒家吸收借鉴，以至于属“土”的黄色，被附加上了“正统”以及“尊崇”的色彩，隋唐以后成为了皇权垄断的专属颜色。通过一些古代影视剧我们也不难发现，皇宫里的主打色就是黄色，无论是皇帝的龙袍还是宫殿里的帘子。
努尔哈赤喜读《三国演义》，也通晓汉文化，也知道黄色在各颜色之中的崇高地位？所以从分派八旗指挥权开始，两黄旗就格外被努尔哈赤所重视，正红旗主和镶红旗被交给了代善、正白旗交给了皇太极、镶白旗给了杜度、正蓝旗给了莽古尔泰、镶蓝旗给了阿敏，至于正黄旗主和镶黄旗努尔哈赤都留给了自己。
清天命十一年（1626年），皇太极继承汗位之后为了巩固权力，对各旗旗色和旗主进行了调整。他将多铎、阿济格二人统领的正黄、镶黄二旗旗色改为正白旗和镶白旗，随后又将自己亲领的原正白旗改色为正黄旗。原镶白旗改为镶黄旗，旗主也由原先的杜度改为皇太极长子豪格。皇太极的这一番变动，让原先各主旗贝勒的权力分散，其自主性也明显降低，围绕皇太极的中央集权得到了空前强化。
皇太极天聪九年（1635年），正蓝旗旗主莽古尔泰意图谋反，失败后诛，正蓝旗便落到了皇太极之手。当时皇太极亲领的只有正黄一旗，于是皇太极将正黄旗与正蓝旗重组，编成了新的正黄旗和镶黄旗。而原先给豪格统领的镶黄旗，也被改成了正蓝旗。自此，正黄与镶黄两旗固定下来，直到清朝灭亡也没有再有变动。
需要说明的是，两黄旗编制的固定，并不代表满洲八旗的其他各旗固定。
顺治五年（1648年），豪格因被多尔衮以摄政王的身份陷害下狱随后暴亡，正蓝旗无主，多尔衮顺理成章的收入了自己的囊中。当时多尔衮只统率正白旗，于是他两正蓝旗与自己的正白旗重新整编，成了新的正白和镶白两旗，而胞弟多铎统领的原镶白旗被他改成了正蓝旗，这便是八旗旗色的最后一次变动。
从八旗旗色的变动过程中，我们不难发现这样一个特点：无论是努尔哈赤还是皇太极，都在将自己直接指挥的旗变成黄旗，所以八旗之中最尊贵的旗色无疑是两黄旗。但是正黄和镶黄两黄旗之中，哪一旗才是地位最高的呢？
顺治七年（1650年），摄政王多尔衮暴毙，顺治帝开始亲政。为了进一步强化皇权，他将多尔衮的正白旗收归自己直辖，并且将皇帝亲统的正黄、镶黄和正白三旗定为“上三旗”，其余五旗则为“下五旗”。
上三旗作为皇帝的亲兵，包揽了禁卫皇宫、保卫皇帝任务，下五旗则驻守京师及各地。至雍正帝时期，为了进一步加强中央集权，再一次对八旗进行了调整，并且以镶黄旗为头旗。
从这里就可以看出，八旗之中以“上三旗”为尊，而“上三旗”之中又以镶黄旗为首。整个八旗之中，哪一旗最尊贵已经很明确了。有清一代的9大贵族(即瓜尔佳氏、钮祜禄氏、博尔济吉特氏、舒穆禄氏、叶赫那拉氏、辉发那拉氏、乌拉那拉氏、郭络罗氏、伊尔根觉罗氏）以及2大外戚部族(即董鄂氏和富察氏），无一例外都出自于镶黄旗。
清朝这股以镶黄旗为尊的风气也深刻地影响了后来的慈禧，慈禧本来出身于镶蓝旗，但是在一步步成为大清帝国的最高实际统治者之后，她也将自己全家的旗籍抬入了镶黄旗。为何上三旗里的正黄、正白不行，偏偏要进镶黄旗？慈禧此举足以证明了，镶黄旗是清代八旗中最尊贵的一旗。至于正黄旗，虽然同为皇帝亲掌且颜色纯黄，但在事实面前也只能向镶黄旗低头。
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