在海湾战争中，爱国者导弹与飞毛腿导弹的较量堪称经典。在此之前，从未有过反导系统与弹道导弹在战场上面对面的交锋。在1991年1月18日时，爱国者首次击落了一枚瞄准沙特阿拉伯发射的飞毛腿导弹，从而使得其名声大振，一时间俨然有了“保护神”的风范。然而仅仅在一个多月之后，在2月25日时，同样是一枚飞毛腿导弹，就突破了爱国者的拦截，一次性杀死了28名美军士兵。那么，在爱国者和飞毛腿的较量当中，到底谁更胜一筹呢？
根据公开的情报，在海湾战争期间爱国者导弹平均需要打四发才能保证对飞毛腿的拦截。在沙特使用的时候，则是三发。需要注意的是，在海湾战争期间，多国部队保持着绝对的空中优势，并且早在战前就把伊军的飞毛腿导弹发射车当成需要优先清除的头号大敌来对待。在这个环境下，伊军的飞毛腿导弹组织不起来成规模的攻击，而多以零散发射的形式进行骚扰。即便如此，爱国者导弹的消耗速度也远超了飞毛腿导弹的消耗。在低强度的交战中，消耗大一点随后补上就是了。但一旦遭遇有能力组织成规模导弹攻击的对手，恐怕爱国者导弹在备弹打空之后就无计可施了。
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