母珠这是指在一串佛珠的终结部位有一个较大的有三个孔的珠子亦称“三通”，这三个孔成丁字形分布，在穿佛珠的时候将线的两端由贯通的两个孔中间传入中间上方的孔中，这个形势在后来的说法上称为万法归一，在最初的印度佛珠上并没有这个三孔的母珠，而是直接以一颗两孔的大珠汇总，至于是何时开始有的这个母珠的形式现在还不得而知（有一种说法是在宋朝中叶时期这种说法的根据不得而知，但这不是关键问题所以不做讨论）。
在近代尤其是到清代以后，很多的人在使用佛珠的时候将这颗母珠和上面的佛塔置换成为与子珠不同材质的珠子，而代之以颜色不同或者更高级的材料，多以宝石制成。在这方面使用的比较多的材料是青金、密腊、翡翠、玛瑙和珊瑚。在置换的时候往往母珠和佛塔的材料与其它三颗节珠相同。
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