卵巢囊肿是女性特有的疾病，每个年龄段的患者都有。疾病长期存在对女性有一定的危害：
第一，月经不调。卵巢上长有囊肿，它的组织结构就会发生改变，这样很可能影响到卵巢的内分泌功能，出现激素分泌不均衡的现象。而体内激素异常是导致月经不调的主要原因。
第二，引起卵巢早衰及容颜衰老。卵巢囊肿的出现，引起体内激素分泌失衡，卵巢功能也可能提早衰竭。而体内雌孕激素分泌不足，会引起皮肤代谢异常，导致容颜提早变老。
第三，卵巢囊肿对女性的生育功能也有一定的影响。卵巢里有囊肿，其排卵功能受到影响，受精卵无法顺利结合，受孕率就会降低。
根据患者的年龄、临床症状、卵巢囊肿的类型和大小，医生会选择不同的治疗方法。
临床上发现有卵巢囊肿，但是没有任何症状，医生通常会对患者进行观察，如果囊肿自行消失则不需治疗。体积较小者，医生可能给予药物治疗。
如果囊肿持续存在或增大、有恶变的风险(如绝经后妇女出现卵巢囊肿)、或发生破裂、扭转时，需手术治疗。
急性期治疗
当卵巢囊肿破裂或出现蒂扭转等急腹症时，应急诊手术治疗。
一般治疗
患者没有自觉症状，超声提示囊肿较小、其内充满液体，医生可能会让其观察等待，看囊肿在几个月内是否会自行消失。同时，医生会建议定期做超声检查，检测囊肿体积是否改变。
药物治疗
由于个体差异大，用药不存在绝对的最好、最快、最有效，除常用非处方药外，应在医生指导下充分结合个人情况选择最合适的药物。
尚无手术指征的囊肿，可采取中西药物保守治疗，具体根据囊肿性质决定。
如为内膜样囊肿，可口服短效避孕药。
如怀疑为炎症性囊肿可口服抗生素或中药活血化瘀。
常用的手术方法
包括卵巢囊肿剥除术(仅切除囊肿，保留卵巢)、患侧卵巢切除术、全子宫切除术或附件切除术(如果囊肿癌变，可能需要切除子宫、卵巢和输卵管，同时切除卵巢和输卵管被称为附件切除术，术后可能需要配合放、化疗)。
手术方式主要有开腹手术或腹腔镜手术。开腹手术主要针对可能癌变的囊肿，医生会在腹部做一个大的切口。而腹腔镜手术适用于比较小的囊肿，医生会在患者肚脐上面或下面切开一个小口，然后将带有摄像头的腹腔镜插入腹部，可以帮助观察腹部情况。
中医治疗
按照中医理论，卵巢囊肿造成女性气血失调，辩证上可分为气、血、津液三种类型，尽管现在对其分型有所不同，但均围绕其病机分型，治疗上建议从“气滞”、“痰湿”、“血瘀”、“湿热毒邪”等方面入手。
气滞血瘀型：治以疏肝理气、活血化瘀、软坚散结，方用膈下逐瘀汤加减。
痰湿壅盛型：治以行气化痰、散结消壅，方用苍附导痰丸加减。
湿热淤结型：治以清热解毒，软坚散结，方用银甲丸加减。
此外，还有针灸(常用温针灸)、理疗、中药灌肠等中医治疗方法可有一定效果，须在正规医疗机构中在医生指导下进行。
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