牛油果的病害有很多种，常见的有炭疽病、疮痂病、斑纹病、穴壳病等。碳疽热危害果实，使果实长出凹陷的圆斑，需低温贮藏。溃疡病也会有一个病斑，不过对果肉的品质没有影响，可以用波尔多液来治疗。叶斑病可引起裂果，使其他病菌入侵，可用嘧菌酯防治。
一、炭疽
该病为牛油果的一种重要病害，对果实危害很大，同时对叶片、花朵、枝条均有影响。病果先长病斑，直径不超过5毫米，呈圆形。以后病变的斑块就会逐渐扩大，并向内凹。熟果还会侵入果肉，造成果实腐烂。病枝需剪去病枝，以免它们互相传染。水果需要在低温下贮藏，运输过程中要避免损伤。
二、疮痂病
此病与炭疽病的情况相似，发病后呈圆形、褐色的突起，后来逐渐变为浅紫色，等到果实成熟时，中间会凹陷，果皮也会粗糙。尽管疾病不会影响味道，但它看起来非常难看。初发时，叶片上会出现褐色斑点，表面起皱，此时需剪掉叶片，以免病情继续恶化。另外还需要喷洒波尔多液，这样才能起到治疗作用。
三、尾孢斑病
叶柄、茎、果均可造成果实腐烂，果皮裂开后。在发病之初，叶片上出现棕色的斑点，直径2-5毫米，后来变成紫色，会扩展到叶片两侧，形状也不规则。发病后应及时喷洒铜制剂和嘧菌酯，这样可有效防治。
四、小穴壳果腐病
在发病初期，果皮上会出现红斑，以后，病菌就会从果实内部感染，果肉上出现棕色条纹，果肉周围有褐色斑点。当其成熟时，病斑会变黑、凹陷、皱缩，果面会被菌丝包裹，内部腐烂，发出恶臭。若有病，应立即剪去病枝，清除枯枝及病果，并适当施肥，增加其抗病能力。
