淮河入海水道位于淮安、盐城市境内，西起洪泽湖二河闸、东至滨海县扁担港，全长162.3千米。二期工程在一期工程基础上，按设计行洪流量7000立方米每秒标准，扩挖全线深槽，加高加固两岸堤防，扩建二河、淮安、淮阜、滨海、海口5座枢纽建筑物。除了水利功能外，开辟了长江以外的第二条入海航道。按二级航道施工，可航行2000吨船。
淮安枢纽布置在入海水道与京杭运河交汇处，主要有：一期地涵北侧扩建30孔立交地涵，北堤防汛交通桥，在古盐河涵洞东侧扩、古盐河泵站，扩建清安河泵站、清安河尾水地涵，渠北引水涵，淮扬路旱闸复堤，新建高架桥，对范围内河道扩挖和堤防加培，并为淮河出海航道预留船闸位置。
具体为扩建30孔，一、二期共45孔。地涵采用斜交布置、“上槽下洞”的立体结构形式，上槽为宽80m的京杭运河渡槽，下洞为孔口尺寸6.8m×8.0m的入海水道泄洪涵洞。地涵底板顺水流方向总长112.6m，扩建地涵宽度244.58m，一、二期地涵总宽度427.06m。北堤防汛交通桥跨越京杭大运河连通北堤，全长358m，桥面宽为9.0m。在原古盐河涵洞东侧扩建设计排涝流量84m3/s的古盐河穿堤涵洞、新建设计流量45m3/s古盐河泵站和31m/ s 临时机口。在清安河穿堤涵洞西侧扩建设计排涝流量22m/ s 的清安河泵站，新建设计流量14m3/s的清安河尾水地涵连接清安河穿堤涵洞下游至小南泓。拆除渠北闸，在闸址处新建渠北引水涵1孔2.0m×2.0m钢筋混凝土箱涵。废除淮扬公路旱闸，拆除淮扬漫水公路，在淮扬漫水公路上方架设跨越入海水道和总渠的高架桥，桥梁长1450m,桥面为双幅单向双车道2×12m。
,
