免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation）也成为Co-IP,当2个蛋白发生互作时，可以通过其中一个蛋白结合某种介质（磁珠）进行沉淀富集，把与它互作的所有蛋白都可以一起沉淀下来，因此可以对沉淀后的样本进行蛋白检测，就可以确定蛋白之间的互作关系；因此此技术称为免疫共沉淀。
1.优点
（1）可信度高：一般用细胞或者组织样本进行检测，同物种且体内原始蛋白，不会出现异源表达对蛋白的影响，以及不会因为表达部位不同而导致假阳性的存在，因此可信度高；
（2）周期短：若直接用组织或者细胞进行实验，一周能出来结果；
2.缺点
（1）通量相对低：可以同时做1个蛋白和多个蛋白的互作验证；
（2）若用293T做检测，或者进行改造载体转染293T细胞，记性coip实验，可以解决在体组织细胞难取的问题，但是难点是周期长，表达难度大，需要进一步验证；
（3）IP技术相对难；
（4）最终检测手段WB比酶标仪麻烦一些；
3.实验步骤
（1）总蛋白提取：样本中加入蛋白提取液200uL；上蛋白质能研磨仪，低温研磨2min；4℃,12000rpm，离心15min,收集上清，上清BCA蛋白定量法测定蛋白浓度为9.825mg/ml，约180uL。
（2）取10uL全蛋白，作为input以备Western blot分析，剩余样本加入1μg相应的抗体，4℃摇床孵育过夜；
（3）取10μL protein A 琼脂糖珠，用适量裂解缓冲液洗3 次，每次3,000 rpm离心3min；
（4）将预处理过的10μL protein A 琼脂糖珠加入到和抗体孵育过夜的蛋白提取物中4℃摇床孵育2-4h，使抗体与protein A琼脂糖珠偶连；
（5）免疫沉淀反应后，在4℃以3,000 rpm 离心3 min，将琼脂糖珠离心至管底；将上清小心吸去，琼脂糖珠用1mL裂解缓冲液洗3－4次；最后加入15μL的2×SDS 上样缓冲液，沸水煮5min；
（6）SDS-PAGE, Western blotting分析确定相互作用蛋白。
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