在生物的演化中，眼睛的出现就是一件非常神奇的事情。
眼睛的起源，其实非常非常的早。
从生物的进化还处于单细胞阶段，眼睛最初的功能就出现了——感光。感光色素的出现，给了单细胞生物感受光存在的能力，也就出现了生物的趋光性。尤其对于通过光合作用自养的生物来说，拥有趋光性对于其生存有着极大的好处。举个典型又非典型的例子——眼虫：
眼虫
眼虫的眼点内含有感光色素，眼点具有感受光的强弱的能力。并且眼点呈杯状，光只能从“杯子”开口的位置射入，这有给了眼虫感受光方向的能力，以便其调整运动的方向，更好地进行光合作用。
眼虫的非典型性在于眼虫既有植物的特征（叶绿体，光合作用），又有动物的特征（鞭毛，运动），并非动物进化树中的一支。
拥有感光能力的并非只有动物的眼睛，动植物中都存在着感光器官，但它们的作用是感受昼夜的变化，调节生物的节律。
图中三角涡虫头部两个黑点即眼点
这时候的“眼睛”，仍然是个杯状的小水坑，内含含有感光色素的细胞。可以让特定方向的光线射入，感受光线的强弱方向。不同的是，这个小水坑不再是由一个细胞器组成，而是由多细胞构成的一个简单而原始的器官了。而杯子的底部，就是原始的视网膜。另外，动物的神经系统的进化与发达，也是眼睛进化功能的巨大助力。毕竟眼睛是服务于神经系统的感受器，神经系统需要足够发达，才能处理眼睛收集到的信号并作出正确的反应。
图为三角涡虫的梯状神经系统
低等动物的眼睛，只具有感受光的强弱、方向的能力，其形态、数量都与我们所熟知的眼睛结构相去甚远。例如水母的眼睛的视网膜是一块内含色素的板状结构，文昌鱼的眼睛只是神经管侧的两个小黑点。
在继续进化的路上，不同环境中的动物，受到的环境压力各不相同，自然选择的结果也天差地别，这也导致了眼睛的进化也呈现出很高的多样性。
我们先来看看，向着 人/哺乳动物 方向进化的这一支的眼睛的变化。首先眼睛的大小和形态发生了一系列的变化：
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眼睛由原来只是充水的洞，逐渐演化出封闭的内部结构——视网膜-玻璃体-角膜-晶状体-虹膜等等。眼睛在结构上变得更加复杂，内部更加稳定。
由于角膜、晶状体等结构，对于光线的折射作用更大，因此在这一过程中，眼睛的曲率也必然发生了变化。
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每一个新的结构出现，对于眼睛的视觉能力，都有着质的飞跃。
首先空洞被细胞液填满，这使得眼睛结构具有更加稳定的折射率，并且对视网膜起着保护作用。这一结构功能等同于人眼的玻璃体。
角膜的出现将眼睛封闭，结构更稳定，并且制造了更大的折射率，增加了视野。
晶状体以及其周围的睫状肌的出现，晶状体的收缩舒张，让眼睛实现了可以手动对焦的能力。
虹膜的出现，又让眼睛可以调节进入眼睛光线的多少，以便适应不同亮度的环境，增加了调节光圈的能力。
（我用照相机的结构来描述眼睛各部分的作用，其实照相机才是人眼睛的山寨版！）
伴随着眼睛结构的复杂化，必然是视神经与中枢神经更加的复杂化。视网膜上多种视觉细胞和感光色素的出现，意味着眼睛也告别了黑白电视时代，开始有了色彩。人的视网膜感光细胞主要分为两类，视杆细胞和视锥细胞。
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视杆细胞内含的感光色素是视紫红质，视杆细胞负责感受光的强弱。而视锥细胞负责感受色彩，目前主流学说认为存在3种含有不同感光色素的视锥细胞，通过对于红绿蓝3种颜色的反应组合，而构成了人眼所见的色彩。
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