韩国一个偏远的山村谷城郡发生了一起惨案，死者为本村的一位参农和他的妻子。
这起命案不仅惨，而且非常诡异。
案发地为死者屋内，现场一片狼藉，床位凌乱不堪，床前摆满了一圈蜡烛，而且还有一只死乌鸦。而屋檐外则挂着骷髅头形状的植物。
犯罪嫌疑人是一个叫朴炳国，他被铐在门外，两眼翻白，满脸血泡，非常吓人。
不过这些异常的现场并没有引起警方的注意，村里的警察钟久断定朴炳国是因为吃了毒蘑菇导致精神错乱而杀人。
电影《哭声》的故事便随着这起渗人的命案缓缓展开。
一波未平一波又起，紧接着另外几件诡异的事情又接连发生了。
村民朴炳载在山上发现了一只死去小野兽，他惊喜地准备将之扛回家，却不小心滚下山崖摔晕了，醒来后，他发现一个仅穿一条裆裤的老人正在啃食野兽，满嘴是血，发现他后便向他扑来，他吓得慌忙地逃下了山，并大肆宣扬在山上撞见了鬼。
夜晚一户村民家发生大火，警察钟久匆匆赶到现场，却撞见这户女主人正发疯似地乱咬人，他自己也被女人扑倒在地撕咬，好几个人费了九牛二虎之力才将女人拉开。
第二天火灾女主人在一棵树上自缢身亡，而且全家人都被杀害，警方经勘查后认定这个女人就是凶手。
这时，一个村民 告诉了钟久一个秘密，那就是这个自缢的女人被一个国村隼的人侵犯过。
这个国村隼是个外来者，之前朴炳载再山上看到啃食野兽的老人其实就是他，而且他还在那晚的火灾现场围观人群中出现过。
村民的这个信息让钟久推翻了他自己之前认定的吃毒蘑菇杀人之说，将怀疑对象指向了国村隼。
在火灾现场外面，一个神秘的女人不断朝他扔石头，然后私自闯进了案发现场，并告诉他她亲眼目睹女主人杀了全家人，但这一切都是那个日本人捣的鬼，那个日本人是魔鬼，如果经常见到他，那么就是他缠上你，想弄死你。
钟久听后震惊不已，同时立即打电话给同事说找到目击证人了，但等他赶回屋时，这个神秘的女人却突然消失不见了。
已经将村国隼列为嫌疑人的钟久找到之前在山上收到过惊吓的朴炳载一起上山找人，原本晴空万里的天空却突然下起了大雨，朴炳载还被雷劈了，钟久连忙把他送到医院，却亲眼目睹了被警方逮捕的第一起案件的嫌疑人朴炳国在医院扭曲惨死。
经历了如此的怪异的事件后，钟久郁闷的喝完酒回家，却发现熟睡中的女儿突然痛苦地大喊起来，并对他说有个阿姨一直想进屋里来，女儿清晨醒来后便暴饮暴食，还大口地吞着她之前从不吃的鱼。
老妈认为女儿中邪了，要钟久找个巫师来做法，但钟久却不信这一套，而是更加加深了对日本人村国隼的怀疑，为了女儿，他迫不及待地带着同事和其懂日语的侄子上山找国村隼。
一行人来到村国隼的住处后，发现对方并没有在家，但他们却发现屋内有很多异常：吓人的面具，鸟类摄影书，春宫书，摆有羊头的神龛，贴着大量照片的祭台。
更令钟久气愤的是，他还发现了女儿丢失的一只鞋，这么多难以解释的现象，让钟久认定村国隼就是个变态，之前发生的一切就是他在从中作祟。
钟久回去后，发现女儿性情大变，不仅在她的作业本上发现了诡异的涂鸦，还发现她的腿上长满血泡。
忍无可忍的钟久再次冲上山去找国村隼，结果发现他屋内那些照片等诡异的东西都不见了，国村隼表示都被他烧了，钟久砸了他的屋子，并让他在三天之内滚出村子，否则就对他不客气。
结果回家后的次日，钟久家门口挂着一只血淋淋的黑山羊，而且女儿竟然对邻居奶奶动起了刀子。一直是乖乖女的女儿突然变成这样，使不信邪的钟久终于妥协，答应请巫师来做法。
巫师日光来到了钟久家中，查看一番后，发现他家中一个盖着红盆子的酱缸有异常，砸开一看，里面竟然有一只死去的乌鸦，这让钟久开始相信家中确实可能有邪祟。
巫师日光装模做样的做了一通法，并告诉钟久他家中有鬼，而且这只鬼很厉害，这只厉害的鬼就是那个日本人国村隼，他要做一场大法事才能收拾这只鬼，示意钟久准备一大笔钱。
钟久虽然开始相信巫师日光的说法，但是他还是忍不住发出了心中的疑问：“那个日本人是个大活人，怎么会是鬼呢？就算他是鬼，他为什么又会缠上自己的女儿呢？”
日光解释说鬼不一定都是死人，鬼害人就像钓鱼者洒下诱饵，他的女儿刚好捡到诱饵，所以才会这样。
巫师日光开始做法，钟久的女儿随着法事的进行越发痛苦的扭曲，钟久不忍心女儿遭受痛苦，于是叫停了法术。
而国村隼也在自己的家中举行这一场法事，但法事失败，他痛苦抽搐，然后爬到门外昏迷，醒来后虚弱的他发现了一个神秘的女人，这个女人就是之前在火灾现场朝钟久扔石头的那名女子。
国村隼焦急地跑到野外一辆卡车前，发现之前死在卡车中的村民朴春裴的尸体不见了。
经历这么多不解的事件后，钟久去寻求神父的帮助未果，便叫上好友再次来找国村隼，想确认他究竟是不是鬼，结果撞了变成僵尸的朴春裴，棍棒刀对这家伙都不管用，众人各种被咬，就在众人束手无策时，僵尸却自己挂掉了。
惊魂未定的众人发现了躲在树后的国村隼，当即展开猛追，国村隼在慌乱的逃跑中掉入了山崖才摆脱钟久等人的追捕，山崖下的国村隼发现那个神秘的女人在盯着他，于是向女人追去，结果从山上掉下来，正好被开车往回走的的钟久撞上，钟久以为他死了，于是便把他推下了山崖。
于此同时，巫师日光在村中遇见那名神秘的女子，一见到他，日光便大口呕吐，鼻血横喷，仓皇逃走。
方寸大乱的他回到住处求佛祖保佑，结果蜡烛全部熄灭，他仓皇地驾车准备逃离，结果在路上遇见飞蛾不停地撞向他的车，挡住了他的视线，致使车辆失控。
惊魂未定地日光停车后想了一下，连忙掉头返回谷城郡，同时打电话告诉钟久说自己之前弄错了，那个神秘女人才是鬼。
急匆匆回家后的钟久发现女儿不见了，他跑出来四处寻找，在街道上遇见了那名神秘女子，神秘女子告诉他，他女儿是被鬼迷住了才那样，让他现在不要回去，否则他全家都会惨死，她已经布好了陷阱，只等鬼上套，鸡叫三声后，他就可以回去。
可是巫师日光也打电话急促地催他赶紧回家，那个女人说什么都不要信。
看出钟久内心动摇后，那名神秘的女人瞬间移动了数米，出现在钟久的面前，钟久转身一看，发现女子的手不是活人的，而且女子身上穿着之前死去的人的衣服，同时发现女儿的发卡从他手中掉落。
钟久对她的信任彻底崩塌，认为之前所发生的一切都是她干的，没等鸡叫完第三声就急匆匆地往家的方向跑去，结果回到家后，发现女儿真拿着刀，全家人都倒在了血泊中。
与此同时，钟久同事的侄子因为叔叔被害，拿着刀去寻找国村隼，最后在一个山洞中发现了他，在和国村隼的对话中，国村隼终于露出本来的面目，变身成恶魔。
《哭声》这部电影的成功之处在于前面运用了大量的神秘事件营造了一种令人后背发凉的恐怖氛围，而且成功的用这些烟雾弹迷惑了我们观众，让我们在巫师、神秘女人和日本人国村隼几人之间为到底谁是坏人而举起不定。直到最后几分钟，才完成多次反转，揭露出国村隼的真面目。
而导演之所以如此大费周章的遮遮掩掩，是因为影片主题涉及到了韩国电影题材最敏感的话题——宗教。
谷城郡这个地方可以说是韩国的南大门，在被日本入侵后，这里曾遭受了日军的各种侵害，而日军当时的国教就是神道教，日本的军国主义很大程度上也是源于这个教。
在侵入谷城郡后，日军大力推行神道教，同时对当地的天主教和其他本土宗教不断排挤，就像日军入侵中国有许多汉奸一样，当时那里也出现了投敌的韩奸。
影片中的日本人国村隼其实就是象征日军的神道教，钟久再他住处发现的各种异常现象都信奉神道教者的特征。
而那个巫师日光其实是和国村隼一伙的，他和国村隼一唱一和，国村隼主刀，负责施咒控灵，害人性命，制造混乱，巫师日光配合唱双簧做法赚钱。
之前的各种诡异案件都是国村隼害人的结果，他之所以作法，是神道教的一种习俗，是为了抚慰死在卡车上的朴春裴的灵魂，结果失败，因此他醒来后便急忙跑去查看，而朴春裴也因为国村隼的做法失败而变成了僵尸。
他拍摄了大量受害人的照片，以及最后在山洞中露出恶魔的真面目时对着追来的钟久同事的侄子拍照，也是因为他即将死亡，对他进行抚灵。
就像日军在侵华战争中对我们同胞实施残忍行为时喜欢拍照留念一样，按照他们的说法，就是杀了你还要变态地抚慰你的灵魂。
国村隼的目的在于以他所代表的神道教摧毁向钟久这样的无神论者，颠覆天主教等其他宗教，达到神道教称霸的目的。
巫师日光用钓鱼者的诱饵来形容鬼作怪的原理，也是对应了影片中国村隼在河边钓鱼的场景。他就代表当时的韩奸，为了赚取个人利益，残害和欺骗同胞。
他最后走进发生惨案的钟久家中，对着尸体拍下照片后便淡定离开，离开时一大堆照片冲盒子打翻出来，这些照片其实就是之前钟久质问国村隼对方说烧了的那些照片，其实没有烧，而是藏在巫师日光那里了。
而那名神秘的女子其实是之前受日军迫害而死的人，他一直在暗中行动对抗国村隼以保护村民，钟久的女儿说有个女人一直想进他家，就是为了保护她，而那个发夹也是她保护他女儿的一种媒介，朴春裴僵尸突然就自己就嗝屁了也是因为她的帮助。
国村隼作法抚灵失败，其实就是她在暗中破坏，只不过导演用平行剪辑将巫师做法和国村隼做法放到一起，让观众误以为他两是在作法对抗彼此。
看到钟久误把她当作凶手，决绝地向家中跑去，她只能含泪发出绝望凄凉的呐喊，因为她拼尽全力也没能阻止悲剧的发生
,
