水准仪的使用包括粗平、瞄准、精平和读数4个步骤。
- 粗平
在准备要安置仪器的地方，打开三脚架，目估架头大致水平，且高度大致应与观测者相适应。再把脚架踩入地面，然后将水准仪固定于三角架上。转动脚螺旋使圆水准气泡居中。具体方法如下：
1、气泡偏离中央，首先按箭头所指方向两手同时旋转脚螺旋1和角螺旋2使气泡移到前后或左右的连线上；
2、按箭头方向转动角螺旋3使气泡居中，此时仪器竖轴就大致处于铅垂位置。
注意：整平过程中，气泡移动的方向与左右大拇指转动的方向是一致的。
- 瞄准
用望远镜准确地瞄准目标。首先是把望远镜对向远处明亮的背景，转动目镜调焦螺旋，使十字丝最清晰。再松开固定螺旋，旋转望远镜，使照门和准星的连接对准水准尺，拧紧固定螺旋。最后转动物镜对光螺旋，使水准尺的清晰地落在十字丝平面上，再转动微动螺旋，使水准尺的像靠于十字竖丝的一侧。
注意：瞄准目标时，应使物象精确落在十字丝平面上，否则当眼睛靠近目镜上下移动时，十字丝交点所对物象（尺上读数）会相对移动，这种现象叫做视差。
消除视差的方法： 仔细反复交替调节目镜和物镜对光螺旋。
- 精平
在使用微倾水准仪时，眼睛通过目镜左边的符合气泡观察窗看水准气泡，右手慢慢转动微倾螺旋，使气泡两端的影响符合要求。
若使用自动安平水准仪（compensator level），仪器无微倾螺旋，故不需进行精平工作。
- 读数
用十字丝的中丝在水准尺上读数，读数的方法从小数向大数读，米、分米看尺上的标记， 厘米数尺面上的格数，毫米估读。
注意：1、读数后还要检查气泡是否完全符合，如有偏差，读数作废，应重新精平，再次读数。
2、当使用微倾水准仪时，当仪器转到另一个方向进行观测时，仍需再次转动微倾螺旋，使管水准气泡严格符合精平后，才能读数。简而言之，就是每次读数之前都要精平，这是微倾水准仪的使用特点。
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