1、个体户和公司在纳税上的区别只是所得税方面，个体户缴纳个人所得税，公司缴纳企业所得税，其他方面都一样的，个体户也可以查帐征收，公司也可以核定征收，公司可以申请一般纳税人，个体户也可以申请一般纳税人。
2、工商方面两个就有区别，一个是个体工商户营业执照，一个是企业法人营业执照，在缴纳工商管理费、注册登记费上，注册成公司的手续相对比较复杂，要验资什么的，费用也多。 3、在经营方式上，注册成公司可以请会计做账，注册成个体户也可以请会计做账，关键是看经营者是否这么做的问题，并不是说注册成公司一定有会计什么的，经营者不设立那也没有问题。
4、如果你想简单方便，注册成个体户在工商手续方面就很方便，不过就怕有些客户看到不是某某公司而看不起，除此之外，在其他方面是经营者自己的要求，没有太多区别。
5、注册个体户还是公司纳税最主要的区别: 个体户一般是税务机关根据其所在位置\规模\员工人数\销售商品等等来估算你的销售额,然后再给定税.不论当月的收入多少，有无收入都要按定税金额来交税. 而有限公司则是要求企业必须核算健全,要有帐,交税也是根据企业自己申报的收入来交税,有收入就交没有就不交. 注册个体户比较好操作,管理简单,人少甚至可以自己就搞定.但很难发展 注册公司手续比较复杂,还要求有一定的注册资金,管理上要求复杂,每月要申报纳税,需要专业的会计人员来运做。
举例：你以个体工商户开一家饮食店，吃出来了问题，你必须用全部身家去赔偿。
公司有：有限责任公司、有限合伙、股份公司、个人独资公司等等，可以选择注册一家有限责任公司，此时你需要承担的责任是有限责任，如果选择个独企业或者合伙企业，可能承担的责任也是无限连带责任。
举例：你成立了一家有限责任公司，注册资金为50万元，因为经营不善导致倒闭，而此时你公司外债欠款100万，作为有限责任公司，你只需要承担注册资金50万元，如果你注册资金为200万，那么你的有限责任就是200万。
相反如果注册一家个独企业或者合伙企业，那么你需要承担的责任也是无限的。
