怎么检索基因对应蛋白的分子量(5步搞定基因表达的蛋白质分子量)(1)

作者:阳光

在实验室,我们经常会做到蛋白质的SDS—PAGE。跑蛋白电泳,我们都知道最主要的就是需要知道蛋白的分子量的大小,这样跑完电泳后通过与Marker的比对,我们才可以知道目的条带的位置,通过考马斯亮蓝染色来分析蛋白样品中是否有目的蛋白,从而为我们进一步的实验提供依据。

对实验新手来说,他们对于蛋白质的分子量的表示以及怎样计算都一头雾水,首先我们谈一下蛋白质分子量的表示。蛋白质分子量的单位为kDa(简称为kD),人们为了纪念道尔顿,以他的名字作为原子质量单位。在生物化学、分子生物学和蛋白组学中经常用D或KD,定义为碳12原子质量的1/12,1D=1/N g,N为阿伏加德罗常数。

接下来我们就来说说如何计算某基因表达的蛋白质的分子量:

1.打开PubMed:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed,选择Gene,输入prss54,点击search,结果如下图,点击第一个

怎么检索基因对应蛋白的分子量(5步搞定基因表达的蛋白质分子量)(2)

2.下拉到下图位置,点击Consensus CDS后的CCDS32463.1

怎么检索基因对应蛋白的分子量(5步搞定基因表达的蛋白质分子量)(3)

3.点进去后下拉到下图位置

怎么检索基因对应蛋白的分子量(5步搞定基因表达的蛋白质分子量)(4)

Translation 即为该基因表达的蛋白质的氨基酸序列

4.打开ProtParam :http://web.expasy.org/protparam/,然后将上图中的氨基酸序列复制粘贴到框中

怎么检索基因对应蛋白的分子量(5步搞定基因表达的蛋白质分子量)(5)

5.点击compute parameters即可得到蛋白的分子量

怎么检索基因对应蛋白的分子量(5步搞定基因表达的蛋白质分子量)(6)

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