高原湖泊是对那些海拔相对较高湖泊的模糊定义，地质构造上多为构造湖。我国的高原湖泊主要分布在蒙新高原地区、云贵高原地区和青藏高原地区。而云贵高原地区的湖泊水深岸陡，入湖支流水系较多，而湖泊的出流水系普遍较少，湖泊换水周期长，自净能力较弱，是对比起来软为脆弱的湖泊。云贵高原地区有九大高原湖泊最为有名，其中滇池、程海和泸沽湖属长江水系，抚仙湖、杞麓湖、异龙湖、星云湖和阳宗海属珠江水系，洱海属澜沧江水系。
滇池
滇池位于云南省昆明市市区南部，面积330平方千米，是云南省最大的淡水湖，西南第一大湖，中国第六大的淡水湖。过去滇池水产资源丰富，有多种鱼类，其中以鲤鱼产量最高，金线鱼最名贵。但是由于近年水质的污染，生物群种结构已产生不良演变。
程海
程海位于云南省永胜县中部，面积75.97平方公里，为滇西第二大淡水湖，是世界上天然生长螺旋藻的三大湖泊之一。然而随着水位下降水生态风险进一步加剧、生态环境恶化势头未能得到有效控制、经济发展与其承载能力矛盾突出，抢救性保护程海迫在眉睫。
泸沽湖
泸沽湖位于四川盐源县和云南宁蒗县交界处，集水面积247.6平方公里，是云南省海拔最高的湖泊，是中国第三大深水湖泊。七年前，因环湖垃圾堆积、废水渗透，泸沽湖生态受到威胁。近年来，当地政府通过环境综合整治，泸沽湖面源污染得到有效控制，全湖自然生态环境得到有效改善，水质长期稳定保持地表水I类标准。
抚仙湖
抚仙湖位于玉溪市江川区、澄江县、华宁县之间，水域面积约216.6平方公里，相应湖容约206.2亿立方米，是我国最大蓄水量湖泊、最大高原深水湖、第2深淡水湖泊。抚仙湖为全球少有的I类水质湖泊，中国环境科学研究院认为：一旦抚仙湖水质严重退化，中国将从此告别拥有优质大型湖泊水资源的时代。仙湖是国家天然的水资源战略储备库，其价值不亚于建立国家粮食和石油的战略储备。
杞麓湖
杞麓湖位于云南省通海县境内，占地31平方公里，湖畔平畴沃野，盛产稻、麦、烟等作物。2014年杞麓湖水质为劣于Ⅴ类，经过多年的努力，杞麓湖水体污染加剧的趋势虽然有所缓解，但尚未得到根本遏制。
异龙湖
异龙湖位于云南省红河哈尼族彝族自治州，水面面积39平方公里，为云南九大湖中最小的湖泊。异龙湖属重富营养型湖泊，进入盛夏，湖内荷花争奇斗艳，清香远溢。2018年底异龙湖水质各项指标稳定达到V类，形式仍然不容乐观。
星云湖
星云湖位于江川县城北1公里处，面积34.71平方公里，是云南省较早有专业部门繁殖和放养鱼类的湖泊。星云湖属营养性湖泊，多年来，玉溪市和江川区累计投入约11亿元用于星云湖的治理。
阳宗海
阳宗海地跨澄江、呈贡、宜良三地之间，湖面面积31.1平方千米。阳宗海污染以生活污染和面源污染为主要特征，主要接纳附近村镇、开发区的生活污水及阳宗海电厂的部分冷却循环水。水体中氮磷浓度水平已超标，超过了富营养化警戒线水平。
洱海
洱海位于云南大理郊区，湖面面积256.5平方公里，为云南省第二大淡水湖。洱海具有供水、农灌、发电、调节气候、渔业、航运、旅游七大主要功能，是大理政治、经济、文化的摇篮。洱海受到了污染，已是不争的事实。今天，若以饮用水源地的标准来衡量，洱海太需要人们的保护了。
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