吉安县古称庐陵，秦（公元前221年）始建县。元置吉安路，取吉州和安福州首字为名，并赋“吉泰平安”之意。1914年改吉安县。1949年10月吉安解放后，置县城于吉安市，市县治同城，1979年10月县城迁至敦厚。
1979年3月3日，江西省革命委员会批准同意吉安县驻地由吉安市市区迁至吉安县永太公社敦厚。同年同意吉安县设立敦厚镇（赣革发[1979]146号）。1984年，恢复天河、永阳镇，管辖原公社范围；油田公社分设油田、盘田乡；富田公社分设富田、云楼乡；大冲公社分设大冲、北源乡；官田公社分设官田乡、安塘乡；新圩公社分设新圩、文陂乡（赣府厅字[1984]198号）。1985年4月18日，设置值夏、横江、固江、万福、东固镇（赣府厅字[1985]231号）。1987年4月5日，将吉安县的樟山、长塘、兴桥三个乡和吉水县天玉乡划归吉安市管辖。将天玉乡的玉山、低坪、砖门三个村委会划归吉水县葛山乡管辖（赣府厅字[1987]166号批复）。1993年，撤销永和乡、新圩乡，设立永和镇、新圩镇（赣民字[1993]53号批复）。
2000年12月8日，撤销桐坪乡、凤凰乡，设立桐坪镇、凤凰镇（赣民字[2001]368号批复）。2001年12月3日，撤销高塘乡，划归敦厚镇；撤销前岭乡、敖城乡，合并设立敖城镇；撤销盘田乡、油田乡，合并设立油田镇（赣民字[2001] 569号批复）。2003年8月19日，将油田镇鹤洲村委会划归万福镇管辖（赣民字[2003]189号批复）。2003年底，全县总人口43.6万人。2004年底，全县辖11镇8乡。
