现在的交通部直属高校只有一所，就是大连海事大学。不过如果加上交通运输部下属的中国民航总局的直属高校，还应该再增加4个名额。其中中国民航大学，中国民用航空飞行学院是本科层次高校。上海民航职业技术学院，广州民航职业技术学院是专科层次的高校。
但是由于这4所高校并非直属交通运输部，所以一般只计算大连海事大学。
其实曾经归属交通运输部的高校还有很多，但是并不包括著名的上海交通大学和西安交通大学，虽然做两所大学，也是因为交通部而命名，但那个事情还在建国以前，建国以后没多久就划归教育部了。
原交通部的直属高校，曾经有8所著名的院校，现在只剩大连海事大学，211工程类的高校。
另外7所的情况是这样的。
1.西安公路交通大学，2000年并入长安大学。长安大学现在是211工程的高校，985优势学科建设平台高校，进入了国家111计划。
2.武汉交通科技大学，2000年合并于武汉理工大学，武汉理工大学，现在是211工程类的高校。
3.上海海运学院，现在的上海海事大学。
4.长沙交通学院，2003年合并于长沙理工大学。
5.南京交通高等专科学校，2000年合并于东南大学。东南大学是985工程类的高校。
6.重庆交通学院，现在的重庆交通大学。
7.山东交通学院。2000年由交通部划转山东省管辖，不过当时的山东交通学院还是大专层次，名字是济南交通高等专科学校。2002年升格本科，更名山东交通学院。
现在的交通大学除了大连海事大学以外，还有交通运输部参与8所共建高校，分别是上海海事大学，重庆交通大学，长沙理工大学 ，武汉理工大学，山东交通学院，集美大学，南通大学，长安大学。
综上所述，交通运输部现有一所直属高校以及8所共建高校，在交通领域拥有自己的优势学科，在铁路，航运，民航方面发挥着重要的作用！
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