羊肚菌整个栽培过程主要包括：菌种制备、播种、补料、保育催菇、出菇管理和采收干制等六个主要环节。其中菌种制备、保育催菇是整个生产环节中的重点。
1、选地
以土质疏松、利水、平整的土地为宜，山地、林地、平原耕采用农田、果树林等均可。田地要求靠近水源，方便干旱季节取水。
2、整地
选择优质的田地，根据地形按水势、风向走势进行整地。在使用农田、水稻田等时，每公顷田需施撒750 kg~l 125 kg的生石灰或3000kg～3750 kg草木灰，起到调节pH值和杀灭土壤中杂菌、害虫的作用；林地、山地以喷洒生石灰为宜。田地翻耕深25cm~30 cm；整成畦，畦面宽l m~1．4 m，长度不限，畦间沟宽20 cm～30 cm，深20 cm一30 cm，确保排水和行人。
3、搭建遮阳棚
在处理好的田地上搭建遮阳棚，遮阳棚长宽任意，净高不低于1．8 m，枝干以杉木杆、粗竹竿或水泥杆为主，枝干间距4 m，4针～6针黑色遮阳网是目前普遍采用的遮阴挡风网。遮阳棚分平棚和拱棚两种：拱棚以地形风向走势，宽5m～8 m，拱高2．2 m～2．5 m，长度据田地而定，不建议超过100 m，以免影响通风。平棚搭建根据田地面积决定，长宽任意，面积2 000 m2—3 340 m2的田地，建议棚高1．8 n,l～2 rn，面积大于6 680 m2，棚高大于2．2 m，以利于通风。在北方地区尤其要注意棚子的抗雪、抗风能力，避免大风、大雪造成塌棚事件。
4、菌种制备
菌种是羊肚菌生产的关键所在，优良菌种是保证丰收的关键。菌种的优劣包括：品种合适、菌龄合适、生命力旺盛、纯净、无污染。菌种制备和常规食用菌一样，分母种、原种和栽培种。菌种的制备时间节点根据播种季节往前推2．5个一3个月为宜，不能过早，以免影响菌种活力。
5、播种
当秋季环境温度降到20度以下时开始播种。选用优良的菌种，在整好的畦面上进行撒播、沟播或穴播，按照每公顷地3 000 kg～3 375 kg的栽培种进行播种。播种结束后，覆土2 cm～3 cm，土壤含水量保持在50％～60％。最后覆盖厚l cm~2 cm稻草或麦秆，可起到一定保湿和避光作用。
6、“外援营养袋”补料
播种后大约1周，菌丝将长满畦面，形成“菌霜”，即无性孢子层(图3b)；播种10d～15 d，将进行整个生产中关键的一步：外援营养的添加，即“补料”处理。将灭好菌的“外援营养袋”按照每公顷27 000袋一30 000袋的使用量，侧边划口后均匀平扣在“菌霜”上，使羊肚菌菌丝可以直接接触外援营养袋”中的培养料，菌丝将慢慢长进“外援营养袋”中并吸收营养，并向土层内的菌丝传送。待菌丝长满“外援营养袋”时， “外援营养袋”的营养逐渐通过菌丝转移至土壤中的菌丝后，移走“外援营养袋”。此时根据气候特点做低温休眠或催菇处理。撤袋与出菇前保持1周以上的低温刺激，有利于菌丝的分化出菇。
7、保育催菇和出菇管理
根据生产当地的气候特点，当冬季结束，春季气温逐渐回升至CC一10℃时，增大空气湿度至85％～95％，土壤水分含量65％～75％，散射光照射，昼夜温差大于10℃，进行催菇管理。条件合适后，菌丝逐渐开始分化，在土壤内部或土层前表面扭结形成原基，最初的原基似豆芽粗细，浅白色。此时的原基最为幼嫩脆弱，须做好保育工作，防止原基夭折。
羊肚菌出菇前l周左右常常伴随着残波盘菌、林地盘菌、泡质盘菌发生，这些盘菌常被菇民朋友统称为“粪碗”，其可以作为羊肚菌出菇的一个标志物，但过多的“粪碗”会和羊肚菌争夺营养，要及时摘除。
播种，培养好的菌种揉碎至大拇指指甲盖大小，按照每668平方米200kg～225 kg的播种量均匀撒播在洼面上，再覆盖碎土2 cm～3 cm，完成播种；补料，按照每668平方米1 800袋一2 000袋的使用量，将灭好菌的“外援营养袋”侧边划口后扣在洼面上，使洼面上的菌丝可以直接接触到“外援营养袋”里面的培养料，成熟的子囊果菌盖上的脊和凹坑明显分离，子囊果不再增大，即可采摘。
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