我国高校主管部门,可以分为国家教委所属院校、中央各部委所属院校和各省、市属地方院校。
20世纪50年代初期，很多高校由部委和地方分别管理，通常分为教育部所属高校、中央部委所属高校和地方所属高校三种类型。1992年后，部门办学的趋势减弱，中央和地方两级办学的新格局逐步形成。目前大体分为两种：中央部属高校、地方所属高校。这两类院校在专业划分学校规模和毕业分配方向上存在着很多不同。
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中央部署
中华人民共和国中央部门（单位）直属高等学校，简称“中央部属高校”，是指中华人民共和国国务院组成部门及其直属机构在全国范围内直属管理一批高等学校，目的是在探索改革上先走一步，在提高教学、科学研究和社会服务方面发挥示范和引导作用。
目前，全国共有中央部委直属高校一百多所，其中，82所（含分校）划归教育部直属管理，其余划归中央其他部委直属管理。比如，清华大学、北京大学、北京科技大学等都是教育部直属的。另如，北京清华大学医学部、大连海事大学、中国人民公安大学、外交学院、中国民航大学等，分别直属卫生部、交通部、公安部、外交部、民航总局等其他部委。
教育部直属高等学校
中华人民共和国教育部直属高等学校指由中华人民共和国教育部直属管理的一批高等学校，是中央部门直属高等学校的重要组成部分。目前全国范围共有75所高校。
二十世纪末，经过高校管理体制的调整，中国高等学校形成了中央政府和省级地方政府两级管理，以省级政府统筹管理为主的新体制。除少数关系国家发展全局的高校以及行业特殊性强的高校继续由国务院委托教育部和其他少数部门管理外，多数高校由地方管理或以地方管理为主。
二十世纪末，经过高校管理体制的调整，中国高等学校形成了中央政府和省级地方政府两级管理，以省级政府统筹管理为主的新体制。除少数关系国家发展全局的高校以及行业特殊性强的高校继续由国务院委托教育部和其他少数部门管理外，多数高校由地方管理或以地方管理为主。
教育部直接管理一批高等院校，目的是在探索改革上先走一步，在提高教学、科研和社会服务等方面发挥示范作用。经过世纪之交全国高校管理体制的调整，一批实力较强、学科特色鲜明的高校划归教育部管理，建国以来国家历次所确定的重点大学多为教育部直属高校。
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