女人怀胎百年却生出一条蛇，观影愉快，开心每一天。男人想都没想就把它吞进了肚子里。它与祸蛇融为一体，拥有了永生的能力。祸蛇诞生于开天辟地的邪物，以吸食人世间的执念和贪欲存活，与天地同寿，真身永不毁灭。
为了阻止它继续在人间祸害苍生，南疆以及北天都毒1x四大门派，合理将祸蛇封印在了女皇的体内。事后又铸造了青龙、朱雀、玄武四大神像将其镇压。女皇因天下苍生无奈吃下人鱼肉，将祸蛇困在了自己体内，从而也获得了世人都想得到的长生不老。
可虽困住祸蛇的本体，但它的虚影每个一段时间就会现身人间作乱。为此四大门派会派最强侍者前去阻止。经过世代相传，世人都称他们为斩蛇之人。东岛的贺茂忠就是上一代的斩蛇之人。他看晴明天生骨骼精奇，从小就教他练习法术将来继承自己的位置。
十年过去，晴明精通各种法术，可就是怎么都学不会最简单的守护咒。就当师傅朝他发起进攻时，晴明急中生智召唤出传送门将其转移。随后他得意的向师傅炫耀，不会守护咒也照样可以打败敌人。
然而师傅却认为他是在玩小聪明，就在这时雪山开始崩塌。师傅预感到大事不妙，一掌将晴明推入传送门里脱险。画面一转zhuan3x，一只巨蛇竟然在冰山里游走。师傅掏出符咒召唤侍神，随着一句句口诀的念出空中开始显现出结印。随即三位侍神降临人间，狂画师挥动手中的神笔，形成无数道复印封住了整个冰山。紧接着雪天狗凭借一双挥舞的翅膀，快速飞到冰山裂口将其封住。最后的金灵子打坐幻化成一颗金丹。师傅服用下肚，法力瞬间倍增，四人合力与其对抗，但很快几人布置的结界就被巨蛇冲破。眼看大事不妙，众多弟子施展传送门前来助阵，巨蛇张开血盆大口准备对众人攻击。
师傅急忙下令让大家使出守护咒阻挡，唯独晴明不会，他愣在原地片刻后只好召唤传送门尝试。
正如师傅所说的，住不本人的工真。就在危急时刻，师傅将自己的守住咒给了他。虽然让晴明暂时脱离了危险，但他自己却被祸蛇的毒牙刺穿了身体，看到主人危在旦夕，金灵子留下了最后的遗言。
说完朝着祸蛇的方向冲去，师傅祝他一臂之力利，用传送阵将他送到祸蛇的身边。金灵子毫无畏惧的冲进祸蛇的体内。随着一声爆炸，祸蛇的力量也开始消退。雪天狗快速将破裂的冰口封住。晴明以为这场人蛇大战终于结束了，可师傅却告诉他，刚刚的祸蛇只是他的虚影，他的真身被封印在了天都城里。师傅因为刚刚受了重伤，将后事交代给晴明后身体开始扩散。为了继续完成师傅的使命，晴明孤身一人来到天都城，在这里他见到四大门派的代表，分别是法师龙液，内廷的贺守月法师。但隔天准备与大家见面的西域洪若法师，却离奇死亡了。公主立马召见几位代表，他怀疑凶手就是其中一人。因为司天监内早以布满了结界，连一只鸟都飞不进来。随即阿龙拿出寻找妖物的蝌蚪，不料蝌蚪直接就指向了晴明。正当公主要派人把他带走时，博雅却站出来为他证明。原来他一直怀疑晴明半人半妖的身份。昨晚私自在他的寝室装了窃听器，可一夜过去他哪里都没去，根本没有杀人的动机。果然晴明在身上发先了一只妖虫，这明显是有人要陷害他。就在这时，蝌蚪竟然转身将嫌疑人指向了公主。所有都人被惊呆了。堂堂的公主怎么会是凶手，好在龙液及时开口解释，自己的蝌蚪也有判断失误的时候，这才打破了众人尴尬的局面。不过现在谁是凶手并不重要，眼下最重要的就是斩蛇祭天，因为需要四大法师分别唤醒神灵。公主命令贺守月代替死去的洪若法师，然而要唤醒神兽就需要妖怪体内的灵丹。这三天内大家分别出去收集灵力，但唯独只有晴明每天花天酒地。实在看不下去的博雅找到晴明。然而他以为晴明每天在吃喝玩乐，实则是在搜寻情报。因为他分配的是四神兽中最难搞定的青龙。唯独现在有一个最极致的情感欲念，就可以直接唤醒它。就在这时管家送来了新的情报，晴明意识到自己的机会终于来了。两人快速来到公主的房间，只见她已经被怪物倒在了桌子上，请脱去公主的衣服，像蛆一样的东西开始向他爬过来。随后钻进晴明的嘴里，做完一切后公主顺势倒在他的怀里。此时的晴明看上去非常虚弱，于是他让博雅为自己倒一杯水。正当博雅拿起壶倒水时，突然想起晴明刚刚的嘱咐，一会如果我有任何请求，不过听起来多么简单，或者合理，都请你务必不要答应。
于是立马停止了手上的动作，此时晴明如同变了一个人似的，开始抢夺博雅手中的水壶。无奈之下他只好扔了出去，死死的抓住晴明的脚。一时间他的眼睛泛起了红光，博雅赶紧用刀在他的手臂划出一道伤口，将所有毒血全部排出，随后为他注入灵力。此时的晴明开始恢复意识，立马施法在额头上结印，然后一点点将妖物逼出体内。博雅急忙将其拔了出来，妖物瞬间开始消散化成了灵丹。随后晴明将他放置在石像里，瞬间唤醒沉睡千年的青龙神兽。就在这时，房间里传来打斗的声音，晴明和博雅赶紧跑来查看。贺守月竟然说龙液是刺杀女皇的凶手，不相信的博雅极力阻止，龙液趁机扔出妖虫准备逃跑，却不料被身后的发妖勒住了脖子，等晴明斩断头发将她解救出来后，竟发现伤口和之前死去的大师一样。临死前龙液的眼睛一直看着公主，猜到不对劲的晴明晚上找到博雅，说出龙液临死前指认公主就是凶手，但博雅不相信，他怀疑贺守月才是凶手。晴明说出第一次见到贺守月，他就有一种在哪见过的感觉。之后他才得知贺守月就是师傅打造的侍神。为了搞清楚此事，二人分头开始行动，晴明找到公主拿出师傅留下的芳月剑，看到后的公主瞬间红了眼眶。正当他准备说出真相的时候，发妖竟然再次出现，直接将公主杀害。晴明见状立马施法打死了她。然而这边的博雅正准备拿着晴明给的符咒，对贺守月下达不可抗拒的任务，让他将自己的右手斩下。虽然符咒亮起，但贺守月却不为所动，这也证明他已经背叛的师傅的承诺。等晴明赶到后，博雅早已被打晕在地，两人预感到大事不妙。于是来到天台阻止二人释放祸蛇，却不料贺守月召唤出传送阵，将二人各自困在了一间密室。好在晴明精通传送咒，很快就逃了出来。但这边的博雅就没那么好运，沙子已经埋住了他半个身子。好在二人有蓝牙电话，晴明利用符咒定位找到了博雅，一瞬间将他从密室中拉了出来。随后芳月剑自己飞了出来。晴明突然想到师傅的话，此剑斩杀过祸蛇，只要祸蛇出没他就可以感知到。于是二人随着芳月剑，传送到了另外一个地方，没想到他们还是慢了一步。巨大的祸蛇成功降世，所到之处民不聊生。公主看到自己为了获得自由，竟有成千上万的百姓遭受牵连，于是充满愧疚的她做出了一个大胆的决定。只见她抱着身旁的贺守月想要一同赴死，没想到却被祸蛇一口吞了下去。赶到的晴明咬破手指，召唤出最强的三位侍神，吾以鲜血，缚令诸神。杀生石。狂画师，雪天狗应身，两人奋不顾身的朝着祸蛇冲去。狂画师召唤千万张符咒，为晴明和博雅打造了一道保护层。雪天狗经过的地方开始形成冰刺。杀生师利用手里的宝剑，不断破除祸蛇的铠甲。随着一声令下，道道冰刺扎进祸蛇的体内。让二人没想到的是刚刚被吞进肚子里的贺守月，竟然与祸蛇融为了一体。随后她打开传送咒，一把将雪天狗拽过来扔出百米远，贺守月默念咒语，将祸蛇身上的冰刺全部瓦解掉。接着直接冲破了狂画师的结印，眼看祸蛇就要对晴明下手。狂画师扯掉衣服，双手合十形成一道金刚罩，朝着祸蛇的口中冲去。此生无悔，侍奉为荣，狂画师葬身于祸蛇口中。此时玄武、白虎、青龙开启了守护结界，但唯独贺守月负责的朱雀没有反应。原来他早以将里面的灵力吸走，现在唯独打开朱雀的封印，才能阻挡祸蛇逃出天都城危害人间。为此博雅牺牲自己，用血肉唤醒朱雀。眼看祸蛇已经到达城边，朱雀终于有了反应，缺失的结界立马封印起来。而博雅也换了一副模样，成为了晴明的侍神。身后瞬间长出一对黑色羽翼，博雅一飞冲天，与贺守月打的不可开交。晴明趁机打开传送门，带着公主进入了幻象。两人来到师傅临死前的画面，再次让公主见到了朝思暮想的男人。你已经动力情，我不能不走。
那你呢？你有没有动情？公主想要再抱一次爱人，却被一道看不见的隐墙隔在外面。眼看爱人渐渐消散，此刻的她终于明白了要放下心中的执念。等两人再次传送回来，晴明利用传送门将芳月剑送给博雅。博雅悬在半空宛如天神，随后他蓄力一击向贺守月发起进攻，没想到竟被他的守护咒轻松挡下。我让你知道什么才是真正的守护咒。
没想到话音刚落，公主就捡起地上的宝剑，直接放在了脖子上。公主你要做什么？你是不死之身？没有祸蛇！我就不是不死之身。你说过，会永远守护我。看着公主倒在地上，贺守月俨然失去了守护之人。他的守护咒也不公而破，博雅趁机用芳月剑刺进他的身体。此时祸蛇也感受到了痛苦，在临死前对晴明射出无数毒刺。危急时刻，博雅直接挡在晴明的面前，替他挡下了所有伤害，随之他的身体于朱雀神力渐渐消散。祸蛇也化成石像变成一堆废墟。然而就当晴明以为一切都结束了，没想到贺守月竟从废墟中走了出来。拔出身上的剑，朝着博雅的身体扔了过去。晴明奋力召唤出四道符咒保护博雅，贺守月再次发力。芳月剑竟直接穿破结印刺穿了晴明的身体。就在这时他想到了师傅临终前的遗言。阴阳师的真谛并不在于降伏，而在于守护。晴明找到这个世间你想要守护的东西，最终晴明悟到了守护的真正含义。
