有关诺亚方舟之谜至今未解。但近年来，随着考古研究的发展，也有越来越多的事实证明，尽管在《圣经》中说上帝发水一说毫无根据，但在人类历史上确实有过全球性洪水的先例，也就是说远古时代的人们确实经历过毁灭性的水灾。
据《圣经》记载，大约6000年以前世上的人除诺亚和他的一家外都忘了上帝。上帝发怒了，决定惩罚他们。在诺亚600岁的2月17日那天，天窗打开了，上帝连降大雨40天，世界随即变成一片汪洋大海，地球上的一切生物除诺亚方舟外都处于毁灭的边缘。诺亚由于得到上帝的宠爱提前知道洪水的到来，便造了一艘大船，这就是“诺亚方舟”。他和他的家人正是借助这艘船才得以生存下来。同时在逃难中，诺亚还将世界上每种生物都带了一对，这就发展成为今天的人类和生物界。
1850年，考古学家亨利·莱亚德在古亚述国首都尼尼微挖掘出上千片残破的粘土板。这里被考古学界认为是世界上最早的文明古国之一---苏美尔的所在地。经仔细研究，这些泥板被断定已有5500多年的历史。
这幅画是威尼斯圣马可教堂的马赛克镶嵌画。这幅画上面显示在方舟上的诺亚一家人，诺亚将世界上所有的动物从方舟一双双放出。
考古专家乔治·史密斯先生还在这些泥板中发现了一块古巴比伦记述的《古尔盖梅希史诗》中的一段。它记述了一场吞没世界的大洪水中一个叫万塔·纳皮提姆的人和他的妻子乘一条大船逃生的故事，这个描述与诺亚方舟的故事如出一辙。难道还真有这么回事吗？有的学者认为这绝非单纯巧合，其间必有某种联系。有的进一步认为发生洪水的区域可能就是幼发拉底河和底格里斯河，因为这两条河都流经此地。
1955年7月，法国探险家那巴拉带着自己的儿子拉菲尔追寻了诺亚方舟的踪迹。他们根据《圣经》记载，登上了位于前苏联境内海拔5400多米的阿拉拉特山。他们四处勘察，结果在山中的冰湖里发现了一块木块，形状酷似诺亚方舟的残骸。于是，他们带上木块很快离开阿拉拉特山回到法国。后来经科研机构考证，一致确认木块至少为5000年前的建筑物的一部分。而据科学考查，诺亚生活的时代也正是在6000年前左右。那么这块木块及100多年前发现的上千片粘土板是不是诺亚方舟的组成部分？诺亚方舟是否存在过呢？还只是一段传奇的神话呢？
现代科学证明，诺亚方舟的故事发生的时期是第四纪多雨的大西洋期，那时极可能产生巨大洪水。
最早寻找诺亚方舟的是一些虔诚的基督教徒，但没有结果。后来，一些探险家也加入了这一行列1792年、1850年、1876年，探险家们屡次登上阿美尼亚的艾亚特拉山顶，仍然一无所获。
艾亚特拉山位于土耳其东端。靠近伊朗，是一座海拔5065米的活火山，山顶自古就被冰川覆盖。住在这里的阿尔明尼亚人将其称做神山，相信人若登上山顶会被上帝惩罚，故而长期以来无人敢于攀登。
取得突破性进展是在1883年，当时，一次大地震使艾亚特拉山脉的一个冰川地段开裂了，据说开裂处露出了一条船。当时，有个赴艾亚特拉山区考察和评估地震灾情的委员会，委员会的所有成员都亲眼看到过那条大船，船身有12一15米高，因为木船有一大部分还嵌在冰川里，无法估计它的长度。这一消息震惊了当时世界。
多年过去，到了1916年。第一次世界大战期间，俄国飞行员罗斯克维斯基在执行侦察任务之后沿着土耳其与伊朗边境飞回基地当飞越艾亚特拉山上空时，他蓦然发现山顶上有一团青紫色的奇怪东西，极大的好奇心促使他急忙把飞机掉过头来细看，他惊讶地看到山上有一艘很大的船体，船的一侧还有门，其中一扇门已毁坏。他拍下了照片，回去后，把这件事报告了沙俄政府。政府马上派出两个连的兵力去寻找方舟。1个月后，士兵们找到了，并且进行了全面测量，拍摄了大量照片。方舟里有几百个房间，有些交叉的木块做成的大栅栏，这些房子前面还有一排排铁栓……
在此之后，尼古拉二世本打算派探险队考察，但由于十月革命爆发未果。此后，美国、法国一些探险家相继来到艾亚特拟顶，但运气不佳，一无所获。1955年7月，法国的琼·费尔南·纳瓦拉带着儿子拉法埃尔登上艾亚特拉山顶，从冰川中找到方舟残片，带回一块木板，经西班牙、法国、埃及等国科学家研究，这是一块经过特殊防腐涂料处理的木板。经过碳14测定，它的年代至少在4484年前。
1986年4月9日，土耳其官方通讯社宣布，诺亚方舟遗迹在艾亚特拉山被发现。但科学界对世纪大洪水的起源，始终抱持怀疑态度，至今仍不断找寻遗迹以作证实。
不过也有相当多的科学家承认大洪水的存在。据土耳其科学家表示，约在13000至14000年前，世纪大洪水高大的浪潮自今日的黑海漫过马尔马拉海进入地中海，并且在高达数百甚至数千公尺高的巨大浪潮冲进地中海时，淹没了许多人类居住地，因此形成今日的爱琴海岛屿星罗棋布，至少有两千座岛屿，海底下也可能埋藏了许多传说中陆沉的“阿特兰蒂斯城"。
土耳其西部爱琴海国立九月九日大学海洋科学技术研究所海洋研究小组自1995年开始，就与加拿大的多伦多大学合作，搭乘海洋研究船，在土耳其北部黑海及西部爱琴海域进行海层及海底勘察，在黑海海底发现许多疑似早期人类居住的痕迹，推断黑海居民在遭到洪水侵袭后，往最近的高地迁移，即今日土耳其东部与亚美尼亚毗邻的阿拉拉特山(Ararat)区，最高峰海拔五千公尺，后来在洪水减退后又转往埃及等地，缔造了新的文明。
1997年美国哥伦比亚大学地理学家彼特曼(Walterpit-Williamman)与里昂(williamRYen)在《诺亚大洪水》一书中认为：”约在一万年前，冰河时期结束，地中海水位上引后，注人马尔马拉山谷〔即今日的马尔马拉海)，水位涨满后又经由今日的博斯普鲁斯海峡进入黑海，形成《圣经》上所称的世纪大洪水，又称诺亚大洪水。
虽然有关诺亚方舟的发现时而传来，但是坚信此事为子虚乌有的科学家也大有人在。总结起来反驳者的观点主要集中于以下几点阿美尼亚的艾亚特拉山海拔5185米。如果洪水真淹到山顶，有那么多的水，以后这些水怎么会不见了？即使说水全渗入地下，也不会有那么快。据《圣经》描述。方舟体积有43097立方米，这个体积不可能装下世界所有动物的雌雄各7只，何况还有大量的食物需要携带。
诺亚方舟是否真的存在过？或者只是一段传奇的神话呢?
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