原因很简单，省会设于福州最有利于福建全省的政治管理。省会的第一职能是政治管理而不是经济发展，省会设于何地首先取决于该地是否有利于对全省的政治治理。福建全省多山，这在一定程度上增加了管治的难度。历史上福建地区比岭南地区更晚纳入中央的直接管理这一事实，就已经充分说明了这一点。山区交通不便导致信息不通交通困难，这在今天不是什么大问题，无线通信技术和各种隧道桥梁技术可以有效的克服这些障碍。但在通信和交通技术落后的古代，却是一个大问题。以至于历史上在很长时期，福建地区都是实行的地方自治的羁靡制度。
福建第一次纳入直接统治，是在东汉末年三国时期。东汉末年汉政府相继在这里设置建安、建平、南平、侯官等县，这是中央政府第一次直接在当地设置直属行政区划。吴景帝永安三年(公元260年)，分会稽郡设建安郡，郡治设于建安县(今南平建鸥市)。为何将郡治设于建安县呢？这与福建的山川地理有很大关系。福建地形多山，这对于全省的政治管制是一个很大的障碍。但闽江的存在，在很大程度上降低了管制的难度。流域面积占福建全省面积约60%的闽江连通了福建内陆与沿海地区，通过闽江和沿海平原丘陵地区，可以通达福建大多数地区，这就为福建形成一个统一的行政区奠定了基础。而建安县位于闽江的主要支流上，同时也处于通往浙江、江西的交通要道上，这是其成为郡治的基础。
但建安偏处一隅的地理位置，对于福建全省的管理仍然存在不便。因此不久之后，晋武帝太康三年(公元282年)，建安郡被分为建安、晋安两郡。福建东部和南部地区属晋安郡管辖，其郡治设于侯官县(今福州市区)，这是福州成为省会之始。不过在这之前的羁靡统治时期，福州就已是福建的政治中心，当时统治福建地区的藩国闽越国的国都即设于此。
福州能够成为福建的政治中心与其地理位置有关，福州位于闽江下游，通过闽江可以比较方便的进入福建内陆地区；同时福州离海不远，通过沿海丘陵平原地区能够通畅的到达福建的南部地区，而且还有海上交通作为补充，对于全省的管制来说，无疑是十分有利的。自此以后，福州就一直是福建的政治中心之一，在唐代福建定型以后，福州更是成为福建唯一的政治中心。
至于福州作为福建的省会，对于福建的经济发展是好事还是坏事，这就取决于你的立足点了。如果你的立足点是沿海地区，那么福州可有可无。只所以这么说，与福建沿海的经济形态有关。福建沿海的经济是一种外向型经济，它更多与外部世界联系在一起，彼此之间的联系反而不强。因此福州经济的强弱，是否具有带动力，对于沿海各市来说反而并不重要；对于沿海各市来说，外部世界经济形势的变化，对其经济发展的影响反而更大。
但对于福建内陆地区来说，福州的经济带动力强弱，对他们的发展还是有着直观的影响地。由于现代交通通信技术的发展，福建内陆各市已经不像过去那样完全依赖于福州，它们也可以从其他福建沿海城市获得发展支持。但相比之下，福州对他们的影响仍然是最大的，福州经济之强弱对他们的发展仍然具有直观的影响。因此出于全省经济平衡发展的需要，适当强化福州的经济仍有其必要性。这也就能够理解，为什么近年福建省政府会提出提升省会首位度的决策了，这是基于全省平衡发展缩小内陆与沿海经济发展差距的需要。
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