相传倪姓为上古帝颛顼之后。春秋时，邾文公次子邾友封于郳国，其后裔便以郳为氏。战国时，改郳为兒。东汉初年，兒宏辅佐光武帝征蛮有功，遂加人于兒为倪。倪氏世居山东千乘，有双阙倪氏之称。汉代有倪宽家贫行赁于人，劳作时带经而锄，后官至御史大夫，故倪姓多以“经锄堂”为堂号。
余姚倪姓主要聚居于城区及梁弄镇，分属姚江倪氏和贺溪倪氏两大支，皆源出湖州吴兴。据浙江余姚市公安局2012年6月统计，全市有倪姓4414人，居各姓人口第52位。
姚江倪氏迁姚始祖倪思，字正甫，号齐斋，南宋乾道二年（1166年）进士，官至礼部尚书。致仕后自湖州吴兴迁居余姚，住武胜门内“雪昼堂”，卒葬贺溪之南籁山（此贺溪非梁弄贺溪，在今余姚城东穴湖）。姚江倪氏后裔中最著名的当推倪宗正。倪宗正，字本端，明弘治十八年（1505年）进士，选翰林院庶吉士，迁兵部武选司员外郎。正德年间，以言事廷杖，贬太仓知州，累官至南雄府知府。后告假回籍养伤，在“雪昼堂”东翻建新楼，取名“清晖佳气楼”，与王阳明出生地“瑞云楼”隔碧溪河南北相对。卒赠学士，谥文忠。撰有《倪小野集》22卷。今嵊州、新昌境内，也分布有姚江倪氏后裔。
贺溪倪氏始迁祖倪侅，字文载，系倪思从叔。因授绍兴知府，遂家于虞东贺溪（今余姚市梁弄镇横路村）。倪侅配郡主赵氏，生二子。长子倪忠，字天道，由贺溪迁往横山（今上虞小越倪梁），是为横山支祖，其后裔又迁往黄家埠干墩。次子倪愈，字正叟，官天台主簿，赠迪功郎，留居贺溪世守祖业。其后裔又分迁梁湖花浦、南岙、里陈（今上虞永和市安渡）、陈溪小陈上倪等地。
贺溪倪氏后裔中最著名的首推横山支十五世倪元璐。倪元璐，字玉汝，号鸿宝，别号園客。明天启壬戌进士，历任翰林院庶吉士编修，日讲春坊中允，国子监祭酒，兵部左侍郎，户部尚书。崇祯甲申殉于国难，南京弘光朝追赠光禄大夫、太保、吏部尚书，谥文正。清顺治十年（1653年）追谥文贞。倪元璐与曾祖倪铠、祖父倪应蕲、父亲倪冻，四代皆以德行高尚入祀上虞乡贤祠，举世罕见。
贺溪倪氏宗祠原仅三楹，自清廷追赐倪元璐“文贞”后，散居上虞、余姚各地的八支族人便筹款加以扩建，在旧上虞东部各姓宗祠中号称规模最大，档次最高。宗祠座北朝南，前进五开间，正门悬“倪氏宗祠”匾。东首侧门上书“贺溪东来”，西首侧门上书“蟠山大雅”。蟠山即蟠蒉山，又名王蛇山，倪侅与赵氏郡主合葬于此。穿过正门，大天井左右厢房各三间，朝北建有戏台，可容千余人看戏。正堂高悬圣旨匾，匾约高1.5米、长2米，红底金字，正中上方书“旌忠”字样，旁有数百个小字刻录顺治皇帝圣旨。正堂柱子上均有楹联，其中一联为“颛顼分支历邾邦汉相而代著名臣欲思裕后光前務遵往训，岱青肇跡传锦山贺涧以崛兴甲族留念同源合派力振来猷”，简要概括了贺溪倪氏的族史。惜宗祠已于上世纪八十年代被拆，惟留下一棵需数人合抱的古樟树供人凭吊。
贺溪倪氏宗谱始修于元至正丙午年（1366年）。今存民国二十年（1931年）六修本《上虞贺溪倪氏宗谱》十八卷加首末各一卷，共十二册，藏浙江图书馆。谱中有宋太祖御颁《倪氏世谱》、宋绘院供事崔白所绘倪氏历代先祖画像并存御像赞、倪元璐年谱、全祖望撰《明太保倪文正公祠堂碑铭》、黄道周撰《倪文正公墓誌铭》、倪元璐撰《江塘王公祠碑记》等史料，弥足珍贵。（古越东山）
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