鼻窦炎常常由病毒、细菌以及真菌感染引起，对于病毒性感染的鼻窦炎一般可在10天左右症状缓解，而细菌引起的鼻窦炎又分为急性、复发性和慢性，常常迁延不愈，真菌性鼻窦炎较少，主要见于长期使用抗生素或者免疫状况较差的患者。
对于考虑细菌引起的鼻窦炎，一般是需要使用抗菌药物的，鼻窦炎常见致病细菌以肺炎链球菌以及流感嗜血杆菌为主，所以选择抗生素以对此类细菌效果较好的抗生素为首选，一般建议以β内酰胺类为主，比如阿莫西林或者一二代头孢。
对于首选的抗菌素如果药物不敏感，治疗效果差可以进行药敏培养，选择上颌窦内分泌物或病变黏膜惊醒细菌培养，根据药敏结果选择更由针对性抗生素。
阿奇霉素主要针对的是非典型病原体或者混合感染者选择，比如考虑有支原体、衣原体引起的鼻窦炎，它可以单用也可以与β内酰胺类抗生素合用。阿奇霉素这个药物半衰期比较长，所以它的使用也是比较有特点的，一般以每周使用3天停涌天为一个疗程，对于鼻窦炎患者来说，如果需要使用阿奇霉素一个疗程可能不能治愈，需要多个疗程使用抗生素。
需要注意的是非感染性的鼻窦炎，比如过敏性鼻炎与感染性鼻窦炎一些症状相似，比如流鼻涕，打喷嚏，但过敏性鼻炎不使用抗生素，二是以对症处理或者抗过敏、抗炎治疗为主，可使用吸入性的激素治疗。
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