虽然外观各异，但是所有种子植物都有相同的基本轮廓。营养体由3种器官组成：叶、茎和根。叶的主要功能是光合作用，茎用于支撑，根起固定及吸收水分和矿质营养的作用。叶在节上和茎相连，两个节之间的区域称为节间，茎和叶一起统称为地上部。
种子植物有两类：裸子植物和被子植物。裸子植物（Gymnosperm）（来自于希腊文，是种子裸露之意）较低等，已知的大约有700种。裸子植物中最大的类群是松类，包括一些重要的经济森林树种，如松树、枞树、云杉和红杉。
被子植物(Angiosperm)（来自于希腊文，是种子在罐中之意），是种子植物中较高等的，在1亿年前的白垩纪开始大量出现。现在它们在植被中占有绝对优势，远胜于裸子植物，已知的约有25万种，但是还有许多没有进行分类。种子植物的主要进化是出现了花，因此也称为开花植物(flowering plant)。
