总参谋长助理和助理总参谋长不一样。
助理总参谋长应该是副总参谋长（或者是代理总参谋长）之误（我国无助理总参谋长之职），副总参谋长是正大军区级的，在某些方面可以全权代理总参谋长；总参谋长助理一般由大军区的参谋长来担任的，是副大军区级的，这叫平级担任重要职务。
不过，也是提职晋升为正大军区级副总参谋长、司令员、政委的跳板（考察期）。
助理总参谋长也就是代总参谋长就是暂时代理总参谋长的职务，比如总参谋长下台了，上级还没有拟定好接班人是谁那就只好让副总参谋长或其他合适人选 暂时代理。代理总参谋长拥有总参谋长的权利。
总参谋长助理的级别比副总参谋长低一级。但是总参谋长助理是提拔为副总参谋长的优选对象。当上总参谋长助理的话，很容易得到提拔。一般来说，代理总参谋长职务的属于（正大军区或更高级别）总参谋长助理属于（副正大军区级别）。
所以，代理总参谋长比总参谋长助理的官大。
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