腹部CT检查可以了解肝脏、胆囊、胰腺、脾脏、肾脏、腹腔及腹膜后是否有肿大淋巴结，还有腹腔内肠管的情况。而下腹部器官主要属于下消化系统和泌尿生殖系统，下腹部CT主要检查膀胱、直肠、阑尾、肠管，女性的子宫、附件，男性的前列腺、精囊等病变。
除急诊的特殊情况，患者进行腹部CT检查前需要做好肠道准备。良好的肠道准备可以减少诊断的困难，提高诊断的准确性。肠道准备如下：1、扫描前一天进食少渣流质或半流质，在检查的前一天晚22点后不再进食；2、检查前的40-50分钟要喝大量的水，一般喝一千到两千毫升的水，把整个胃肠道充盈起来，并憋尿，目的是充盈胃肠和膀胱，与肠道及其他器官形成对比。
有些人对CT检查有一些误区，以为CT就像透视眼，扫描仪，只要扫一遍，什么毛病都看出来了。其实，CT并没有那么强大，CT扫描出来的是横断面影像，虽然可以看到人体内部器官影像，但这些影像最终还是通过专业医师用肉眼看的。CT对实质性脏器的灵敏度更高，比如肝脏、肾脏、脾脏、胰腺等等，而对空腔器官的灵敏度较低，尤其是肠道，因为肠道分小肠、大肠，光小肠就有好几米，由于肠蠕动，肠子在腹腔内并不是非常有规律的排列的，而且肠道里内容物多，有食糜、肠液、气体，大肠里还有初步形成的粪便，内容物太多就会干扰及掩盖一些病变的影像。对于一些腹腔做过手术的病人，手术后腹腔内结构会发生一些变化，尤其是肠管，CT上观察会发现排列比较紊乱，更增加了诊断肠管内病变的难度。
只能说CT能看到部分肠道问题，比如肠套叠、肠扭转、肠梗阻和消化道穿孔。尤其是肠梗阻和肠穿孔病人可以做腹部CT检查，明确腹腔内是否有游离气体、肠管内有没有气液平。对于肠管内的较大的肿瘤，腹部CT一般能够发现，小于2cm的肿瘤往往因为周围肠道皱褶的遮挡，有可能漏诊，而肠道炎症性病变、微小息肉等CT发现不了。肠道的检查首选还是肠镜，肠镜可以清楚的观察到从肛门到回盲部，可以明确肠道有没有细微的早期的病变。肠镜可以在直视下观察肠道是否充血、水肿、甚至溃疡，还可以取活组织化验，看是否有癌变,这些都是CT检查不能替代的。
随着CT仪器及技术的进步，相比较普通CT扫描，仿真CT内镜技术对肠道病变的观察更有优势，CT仿真内镜是将CT影像进行三维立体重建，以模拟光学纤维内镜效果的方式来显示其腔内结构，可以显示从直肠至回盲瓣，直径大于5mm的肠息肉及肿瘤，对结肠癌的腔内占位或管腔狭窄的发现极佳，但缺点是不能取活检，明确病理诊断。
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