水质恶化的最大原因是投饵过量所引起的水污染以及过滤器污秽所引起的有害质的积存。只要每日的投饵适量，以及适当扫除过滤器与水质调整都可以防止发生。虽然适当的换水也有必要，切勿大量换水，这样对孔雀鱼会有伤害，需要稍稍注意。另外，如果过度清洁过滤器，也同时洗掉繁殖的有益菌，从而导水质恶化。 2. 水温的变化孔雀鱼是属于变温动物，会随着周围环境的水温度变换体温的。水温不论高或低都有碍鱼体机能正常的运作，尤其水温的上升或低下，对孔雀鱼是最大的致命伤。结果体内的代谢不顺，食欲也低下而会衰弱下去，也要注意季节早晚过度落差很多。 3.粗鲁的接触鱼身孔雀鱼的身体表面是特别纤细而易损伤，所以利用鱼网捞起时，要特别小心，否则体表一但损伤，细菌会从伤口侵入而感染。若不用鱼网而用手捞起时，也不要用指甲损伤鱼体。请特别留意。 4.带进病症孔雀鱼容易患病的原因中，估计最大的比例是受到他鱼的感染，若将新购入的孔雀鱼放于水族箱内时，一定要先行确认，是否有病症或先养于检疫缸观察三、五天，确定无病症再放入。
一般常见的病症
孔雀鱼白点病
孔雀鱼白点病
1.白点病症状：鱼体全面会出现直径1mm以下的白色细点，并且一定会从各鳍发病之后再扩散至全身，如不予处置时，将会渐次衰弱不久就会死亡。这是淡水鱼典型病症。尽管孔雀鱼发病率不多，但也不是说完全不会发病，所以大意不得。原因：白点虫等纤毛虫所寄生引发的病症，其体表的白点即是寄生虫的本体。寄生虫的外围的表皮呈白色状者也有，白点愈多则表示寄生状态愈为严重。
孔雀鱼烧尾
孔雀鱼烂身
孔雀鱼烂身
孔雀鱼针尾
孔雀鱼烂尾
2.针尾，烧尾，烂尾症症状：是从尾鳍开始附着黄白色粘着物。不久，再蔓延至各鳍，并渐次糜烂。尤其病情进行时，鳍部会呈烂腐状，甚或断落尾鳍都有。因食欲大减，不久连肌肉也被侵腐而衰弱致死，故有必要及早治疗，发病雄鱼较多，是其特征。原因：遭受卡拉姆那里斯细菌感染所引起，感染途径为伤口，而受伤大部份由于鱼只之间的争斗，粗鲁的接触所引起的居多。
孔雀鱼水霉病
3.水霉病症状：棉花病，但正名为水霉病，多在春冬秋温度较低的三季出现。水霉寄生于体表棉花状，先期寄生部位在尾鳍边缘和背鳍的边缘，不久蔓延至全身而腐烂皮肤，尤其病情进行时水霉繁茂部份会腐烂掉落都有可能。而到了患病中期以后就会失去食欲，游水也欠活泼，不久将会死去。原因：除了水温过低外，体表的伤口或锚虫，鱼虱等寄生所引起的伤口，由水霉科的真菌着生引发二次病症者。真菌大都是饲喂活饵带进来的居多。
孔雀鱼松球病（立鳞病，炸鳞病）
4.松球病症状：又名立鳞病。全身的鳞片竖起鱼体，全面也会鼓满，病名是因为看似松球般乃有此名。如病情进行则鱼鳞会剥落，于是不能再游水而导致死亡。原因：遭受野罗孟那斯细菌感染所引发。
孔雀鱼棉口病
孔雀鱼棉口病
5.口腐病症状：口部外围或颊部附近呈白棉花状而不能再进食，不久，蔓延至腮部将会导致窒息而死。原因：与烂尾病一样，卡拉姆那里斯细菌感染为原因。输入孔雀鱼带来的新感染症状：鳃部肿胀而在水面痛苦中勉强呼吸，并且合闭尾鳍而不时在摇头，做不自然的游水动作，不久，鱼体呈白浊状而衰弱致死。原因：由输入孔雀鱼带进来的细菌为感染因素。而一旦发现感染的鱼只时，必须随即隔离于其它鱼缸。初期者，只有换水可改善。治疗：可使用一些市售的杀菌剂来进行药浴，大部份的情况都会有所改善。若仍然无法痊愈，原因可能在于一些导致细菌性的感染的因素，并未消除，如水温过低，死鱼未捞出等。
孔雀鱼肠炎症状
6.肠炎：病鱼往往是吃了腐败变质的食物造成的。这个病的病因太清楚不过了，都是饲养者喂了过多的食物造成的。病鱼症状为不爱吃食，鱼体消瘦，腹部收缩。
患水霉病症者，可能要注意水质，应捞除死鱼或残饵，并赶快换水，而松球病可能要优先改善水质，药浴除去水中的病原，待鱼较有食欲后，用细菌治疗的药饵喂食。至于烂鳍、烂尾等外表症状的鱼只，换水并佐以药浴，情况也能改善。
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