火影忍者讲的是中学生从性格不成熟走向成熟的成长故事。海贼王讲的是大学生毕业自主创业的成长故事。
第一个区别虽然同是“成长”主题，但是这两个成长是不同的。漩涡鸣人及其伙伴的成长是性格上的转变为主，从不成熟的性格走向成熟。蒙奇D路飞及其伙伴的成长是实力上的成长，从业已成熟的心智走向适应社会的更加成熟的心智。
火影忍者第一部的漩涡鸣人的年龄在一开始是12岁，初中生。这个年龄层——初中生的漩涡鸣人、宇智波佐助、春野樱，分别代表了被排斥的学渣、轻视同伴的学霸、和爱慕学霸的小女生。鸣人，被排斥，喜欢的女孩不喜欢自己，队友是学霸。佐助不懂配合，不注重与伙伴的配合。春野樱看不起鸣人，她眼中只有佐助，哪怕佐助从没有正眼看过她。性格不成熟的主角的成长更加注重的是性格的转变，从不成熟的性格走到成熟的性格，抛弃缺点，抛弃弱小的自己。而性格的成长依附在实力和年龄的成长上，在一场场的战斗中，主角们一步步长大。成熟后的鸣人、佐助、春野樱，都懂得伙伴的重要性。鸣人受到村子里的人的认可，也不盲目迷信春野樱。最不懂配合的佐助杀死大蛇丸之后第一件事就是找伙伴。春野樱也开始重视鸣人。这个就是性格的转变，也就是成熟。
这里的主角不光包括鸣人佐助春野樱，还有木叶同龄人鹿丸雏田小李等，还有砂之国的我爱罗等。在第一部和第二部中都有不同程度的性格转变。可以说性格的转变是火影最大的特色，也是最好看的一点，但是也正是部分角色性格转变不成功，导致第二部诸多地方被人诟病。
对比海贼王，海贼王是不需要性格上的转变的。海贼王第一部，蒙奇D路飞的年龄是18岁。这样的年龄是一个成熟的年龄，不应该有初中生的缺点，比如孤独寂寞，被排斥，路飞都没有。或者说不是没有，是成年人的方式解决。萨博艾斯排斥自己？用耐心和努力感化他们，死缠烂打。乌索普实力太弱？跟不上学霸的脚步，要么脱团要么拼命努力。路飞等人在第一部性格上几乎没有转变。乐观开朗成熟，是海贼王角色的特点，所以海贼王的读者层，一半以上都是30岁以上的人。哪怕是最悲观的乌索普，性格转变也是很小的。路飞的成长是实力上的成长，招数越来越多，实力越来越强。
路飞及其同伴的成熟，对比鸣人及其同伴的不成熟，都是建立在实力和年龄基础下的。路飞及其同伴实力强大，社会人士，为生活，为躲避死亡，队友间的配合是很多的。鸣人及其同伴的实力弱小，学生的生活太安逸了，没有死亡威胁。在死亡威胁下，佐助再不情愿也会和鸣人搞配合的。这个也是为什么中小学生之间很容易小原因排斥别人，社会人士一般不会，因为参加工作之后会比较成熟，多交一个朋友，远远好过排斥一个人。
以上是一个比较大的区别，火影和海贼的主角群的“成长”主题侧重点的区别。
排名第一的回答我也点了赞，不过不是抄袭，本来我就有这个感触。火影是给少年一个成人梦——一群初中生干着大人干的事。海贼是给成人一个少年梦——一群成年人干着初中生想干的事。
以上多次用到初中生，非贬义。
海贼王和火影忍者的第二个区别很多人说过了，就是地图不同。海贼王是走地图，一个个岛过去，主角实力增长，能在新的岛屿遇到更加强的高手。火影的地图是固定的，不能增加新地图。但是这不是问题所在，其实一开始就有了解决办法，忍者等级制度，弱小的忍者一般不会与强大的忍者展开战斗，任务等级不同。其实鸣人如果一步步升级，下忍中忍上忍，也是很好的，最多跳过中忍，成为上忍，但是第二部一上来就是影级实力，这样就导致阅历不足，与长门、宇智波斑等人的思想交锋，就显得底气不足，被人骂嘴遁了。剧情的展开，虽然不必像海贼王一样逐个岛展开剧情，但是也可以通过接不同的任务，来展开不同的剧情，在不同的抉择中体现木叶小伙伴们不同的忍道。这中间鸣人和不同忍村大国小国的接触，见识各地的风土人情和忍术，在不同的磨难中考验鸣人能否坚持自己的忍道。最后再将不同的任务的线索连在一起，成为最后的和晓组织的决战。
就是实力增长的合理性。海贼王的第二部的船员实力是很有讲究的，不能太低，不然第一部到第二部都没有成长了。不能太高，第二部还是要继续成长的。首先香波地岛到鱼人岛，路飞等人一路以压倒性实力打败敌人，展现两年修炼成果。这是必须的，实力必须增长，但是他是不是无敌了呢？不是，冰火岛路飞就被凯撒打倒了一次，告诉我们，路飞的战斗不能大意，果实能力还是可以轻易击败路飞的。接下来的德雷斯罗萨，路飞开始被多佛虐，实力也确定了下来，大概是和多佛相当。而大将藤虎——最高实力的化身的出现，和索隆、罗的较量，也确定了主角的实力和最高实力的差距。这些差距，就是以后路飞等人奋斗的目标，路飞成长的空间。其实大将只是表面上的最高实力，白胡子就几乎秒杀赤犬，可见白胡子实力才是最高实力。而白胡子被称为世界上最强的男人，凯多被称为世界上最强的生物，凯多说不定更强。五老星的战力不明，说不定比四皇还要强大。所以路飞的实力虽说出于七武海上层，但是比起海贼王世界中最强实力，还有一段路要走。火影和海贼的共同主题都是“成长”，而成长到了影级实力的鸣人，到顶了，又怎么成长呢？不失败几次，不经历几次痛苦，好端端的，性格又怎么成长呢？连主角的性格都不转变，火影也失去了它最大的魅力了。比如佐井刚加入第七班的时候，鸣人居然对佐井搞排斥，17岁了，参加工作了，还是12岁的初中生吗？如果他的实力比佐井弱一点，被敌人打几顿，砍掉几只手，就会懂得伙伴配合的重要性了——忍者，可不是那么好当的。这个也是火影烂尾的原因。
就是主角有没有亲自参与制度的维护或推翻。海贼王第二部开始了关于GE MING JUN的出场，路飞之前的各个岛屿也参与了GE MING，但是他自己并不主动参与GE MING，他是主战力、最强战力，但是他的出发点是朋友被欺负了，并不是一定要推翻统治，比如阿龙的统治，娜美不哭，路飞都不出手。而鸣人则主动参与了GE MING，而且，鸣人是现有忍者制度的维护者。佩恩攻打木叶，鸣人一开始是为了保护伙伴，但是在后来和长门的辩论中，他就变成了维护现有忍者制度了。打败长门就是了，还要来场思想交锋，被人骂口遁了吧，说到底就是傲慢，没有经历过战争痛苦同伴死去的忍者说服长门，不被读者骂才怪。你可以打赢对手杀死对手，但是不能直斥对手的思想，这是对对手的不尊重，这是压倒性实力强者对弱者的蔑视。要是鹰眼当年打败索隆，还来一场口遁，表示自己的三观比索隆正，索隆估计要剖腹自尽了，这么被人看不起，临终遗言是：“被人口遁是剑士的耻辱。”鸣人打死角都那场，多好多精彩，一点也不嘴炮，打死敌人，干净利落，自己也半死不活的。
政治、改革、制度、这种东西，主角尽量不要主动涉及，即使涉及也不能是处于主动维护或者推翻制度的一面，必须是为了伙伴、亲人等实实在在的东西，别的都是附属品。美漫中超级英雄为什么受人欢迎，国产电视剧的英雄为什么被人骂街？因为前者喊着“你伤害我的老婆孩子，我打死你”，让人热泪盈眶，感同身受。后者喊着“为了伟大的XXXX，我打死你”，很伟光正，但是给人感觉就不亲民。用金庸的话说，就是“讨论人性，但是不讨论政治，政治会变，人性永恒。”
海贼王内容是简单的“邪不压正”，但是背后的博弈让人越挖掘越深，火影是高深的博弈，但是给人感觉还不如简单的邪不压正。
是自由。海贼王可以自由选择伙伴，火影不可以。佐井的加入，鸣人就极其反对，但是还是得接受。佐助的自由倒是很大，可以自己选择伙伴。火影忍者选择任务的自由也不多，上级命令一下来，鸣人也得杀我爱罗、杀佐助。只是火影第二部中是影级实力，上级对他的态度很好，纲手对他有对待亲弟弟般的感情，所以才没有强迫他。要是团藏火影做久一点，可能会禁锢鸣人的自由，不让他出村。毕竟一个是自主创业，一个是在大型国企中打工，自由程度差别很大。
第六个区别主角性格成熟程度差别大主要是鸣人实在是太幼稚了，第二部中，佐井的加入居然还闹变扭。他是在木叶企业打工的，可不是佐助、路飞自主创业，是不可以选择伙伴的。伙伴的配合程度、信任程度，直接决定了小队存活率。真是安逸的生活下活腻了,忍者学校、卡卡西、自来也对他的保护太多了，导致他的任性程度不是一般的大。还有就是口遁，对战争与和平有着非常幼稚的观点——事实上他的观点不算错，但是没有经历过战争痛苦的人说出这些观点，就显得幼稚无比了，加上对佐井的任性做法，他的观点显得更幼稚了。相比之下，路飞的做法就很明智，“我什么都不知道，你打了我的朋友，我就打死你”，虽然参与了多次GE MING，但是自身并没有政治观点，毕竟他也真的不知道政治观点。知之为知之，不知为不知，是知也。
主角的战斗招式的差别。鸣人的螺旋丸才进化了两三次，一招鲜吃遍天，这就让读者无聊了。战斗技巧也几乎没有进步。唯一的进步就是打角都的时候会用影分身来试探敌人的招数，但是后面抛弃了这个设定，因为九尾太强大了，几乎不必用战斗技巧。对比路飞不断开发新招式，一档招数无数，二档、三档，加上霸气的设定，招数也越来越多。话说都是在名师手下特训两年，一个学会了霸气，一个连九尾的控制都学不好，而且还只是学了控制九尾，真的太不行了。（螺旋丸手里剑也只是学了一个）其实鸣人特训应该学各种类型的忍术、体术、幻术，还有战斗技巧，这样的战斗可以更加的丰富多样了。毕竟号称“意外性NO.1的忍者”，你招数只有一个，谁都知道你下一步要干什么了，不是螺旋丸就是尾兽化。流川枫就是因为只会进攻不会传球，被人看破了招数，才不断被打败，后来他会传球，才打破了困境。
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