胆结石的治疗方法主要有体外冲击波碎石、手术或介入疗法及溶石排石疗法等。
体外冲击波碎石虽为一项非侵入性治疗方法，但是仍存在导致创伤的可能，且治疗适应范围严格，还因受到结石大小、组成成分，胆囊收缩功能等多种因素影响，疗效不能预判，复发率较高，故目前临床应用较少。
手术或介入治疗主要适用于胆管结石、某些慢性胆囊炎、结石直径>2厘米的患者。
介入治疗应用内镜或其他器械对结石进行治疗的方法。对单纯肝外胆管结石可获得治愈，对肝内胆管结石通常作为手术治疗的补充手段，其优点是创伤小，但费用昂贵，对操作者和医疗条件要求相对较高。
手术治疗这是最根本的治疗方法，适用于大部分有症状的胆结石患者，为有并发症患者的首选，胆囊结石行腹腔切开或腹腔镜胆囊手术均可。腹腔镜胆囊手术具有切口小，恢复快等优点，现今应用越来越多。而胆总管结石及肝内胆管结石一般都要行开腹手术。
溶石疗法通过口服溶石药物溶石的方法，目前只对胆固醇结石有效，要求胆囊功能良好，胆囊管通畅。结石越小，溶解率越高，但复发率较高，且对直径大于1厘米的结石效果不好。此外，中医中药排石疗法也是一个很好的选择。可以口服汤药，常用中草药包括生大黄、金钱草、茵陈、木香、枳壳、虎杖等；还有针刺、耳穴埋豆等方法，临床有效率在30%左右，适用于不能或不愿接受手术治疗，或无症状、不存在手术治疗指征的病人。
下列情况即使无症状也应手术治疗：
1.口服胆囊造影不显影；
2.结石直径超过2厘米；
3.存在胆囊息肉样病变、B超发现胆囊壁局限性增厚、X线发现胆囊壁钙化；
4.合并糖尿病的患者应在血糖控制良好的情况下，尽早在未出现合并感染、心肾功能尚正常的情况下预防性切除胆囊。
另外，因其他疾病行开腹手术，如果患者能够耐受，术中胆囊暴露充分，也可一并切除胆囊治疗结石。
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