python机器学习贝叶斯判别分析（Python机器学习十五朴素贝叶斯算法原理与代码实现）

算法原理

朴素贝叶斯是经典的机器学习算法之一，也是为数不多的基于概率论的分类算法。朴素贝叶斯原理简单，也很容易实现，多用于文本分类，比如垃圾邮件过滤。

该算法的优点在于简单易懂、学习效率高、在某些领域的分类问题中能够与决策树、神经网络相媲美。

但由于该算法以自变量之间的独立（条件特征独立）性和连续变量的正态性假设为前提，就会导致算法精度在某种程度上受影响。

marco 博客https://www.cnblogs.com/marc01in/p/4775440.html的简单例子能够很形象说明其核心思想：

python机器学习贝叶斯判别分析（Python机器学习十五朴素贝叶斯算法原理与代码实现）(1)

现在出现一个新的点new_point (x,y)，其分类未知。我们可以用p1(x,y)表示数据点(x,y)属于红色一类的概率，同时也可以用p2(x,y)表示数据点(x,y)属于蓝色一类的概率。那要把new_point归在红、蓝哪一类呢？

我们提出这样的规则：

如果p1(x,y) > p2(x,y)，则(x,y)为红色一类。

如果p1(x,y) <p2(x,y), 则(x,y)为蓝色一类。

换人类的语言来描述这一规则：选择概率高的一类作为新点的分类。这就是贝叶斯决策理论的核心思想，即选择具有最高概率的决策。

用条件概率的方式定义这一贝叶斯分类准则：

如果p(red|x,y) > p(blue|x,y), 则(x,y)属于红色一类。

如果p(red|x,y) < p(blue|x,y), 则(x,y)属于蓝色一类。

也就是说，在出现一个需要分类的新点时，我们只需要计算这个点的

max(p(c1 | x,y),p(c2 | x,y),p(c3 | x,y)...p(cn| x,y))。其对于的最大概率标签，就是这个新点的分类啦。

那么问题来了，对于分类i 如何求解p(ci| x,y)？

没错，就是贝叶斯公式：

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如果要确定某个样本归属于哪一类，则需要计算出归属不同类的概率，再从中挑选出最大的概率。

我们把上面的贝叶斯公式写出这样，也许你能更好的理解：

python机器学习贝叶斯判别分析（Python机器学习十五朴素贝叶斯算法原理与代码实现）(3)

而这个公式告诉我们，需要计算最大的后验概率，只需要计算出分子的最大值即可，而不同水平的概率P(C)非常容易获得，故难点就在于P(X|C)的概率计算。而问题的解决，正是聪明之处，即贝叶斯假设变量X间是条件独立的，故而P(X|C)的概率就可以计算为：

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一般流程

1. 收集数据：提供数据源（一般训练数据与测试数据比例为7:3）；

2. 准备数据：将数据源解析成词条向量；

3. 分析数据：检查词条确保解析的正确性；

4. 训练算法：用训练数据生成的分类器；

5. 测试算法：用训练生成的分类器预测测试数据的结果，对比真实结果，计算错误率，衡量分类器的准确度。

6. 使用算法：通过错误率来评估分类器；

代码实现（python）

myBayes.py：代码实现文件，代码已做了详细注释，包含3个示例：

1. 过滤侮辱文档

2. 过滤垃圾邮件

3. 寻找在线RSS源排名靠前的单词

1 # -*- coding: utf-8 -*- 2 """ 3 Created on Mon Nov 5 14:02:18 2018 4 5 @author: weixw 6 """ 7 8 import numpy as np 9 10 def loadDataSet(): 11 postingList=[['my', 'dog', 'has', 'flea', 'problems', 'help', 'please'], 12 ['maybe', 'not', 'take', 'him', 'to', 'dog', 'park', 'stupid'], 13 ['my', 'dalmation', 'is', 'so', 'cute', 'I', 'love', 'him'], 14 ['stop', 'posting', 'stupid', 'worthless', 'garbage'], 15 ['mr', 'licks', 'ate', 'my', 'steak', 'how', 'to', 'stop', 'him'], 16 ['quit', 'buying', 'worthless', 'dog', 'food', 'stupid']] 17 classVec = [0,1,0,1,0,1] #1 侮辱性, 0 not 18 return postingList,classVec 19 20 #输入：原始数据集 21 #功能：创建一个包含所有原始数据集词语集合，这个列表中词语不重复。 22 #输出：不重复词列表 23 def createVocabList(dataSet): 24 #创建一个空集合，这个集合中内容唯一，并且可动态扩展。 25 vocabSet = set([]) #create empty set 26 #获取每一行数据list 27 for document in dataSet: 28 #将每一行数据取出，合并到vocabSet集合中，vocabSet会自动过滤重复词 29 vocabSet = vocabSet | set(document) #union of the two sets 30 #将集合转化为列表list 31 return list(vocabSet) 32 33 #输入：列表集合（唯一），输入集合（一行文档内容） 34 ''' 35 功能：检查输入集合单词是否在列表集合中，在则在列表集合对应位置设置为1，否则为0 36 将每个词在文档中出现与否作为一个特征，称为词集模型(set-of-words model) 37 ''' 38 #输出：向量列表（判断输入文档中每个单词是否在词汇样本中） 39 def setOfWords2Vec(vocabList, inputSet): 40 #初始化为0，长度为vocabList长度的集合 41 returnVec = [0]*len(vocabList) 42 #检查inputSet中每个单词是否在vocabList集合中，在则在vocabList对应位置置1，否则不作处理 43 for word in inputSet: 44 if word in vocabList: 45 returnVec[vocabList.index(word)] = 1 46 else: print ("the word: %s is not in my Vocabulary!" % word) 47 return returnVec 48 49 #输入:trainMatrix（文档数组（处理为0,1向量）），trainCategory（列标签数组） 50 ''' 51 功能：生成分类器（获取最佳训练参数权值） 52 训练样本以及测试样本大小要相同，通过标签指定行词语类别来计算训练样本对应位置权重参数值。 53 这里有个假定前提，每一行词语是相互独立的，也就有 54 p(w/c1) = p(w0,w1,w2...wn/c1) = p(w0/c1)*p(w1/c1)*p(w2/c1)***p(wn/c1) 55 ''' 56 #输出：p0Vect（文档中非侮辱性词语概率），p1Vect（侮辱性词语概率），pAbusive（标签类中侮辱性标签概率） 57 def trainNB0(trainMatrix,trainCategory): 58 #数据集行大小 59 numTrainDocs = len(trainMatrix) 60 #数据集列大小 61 numWords = len(trainMatrix[0]) 62 #标签类中侮辱性标签概率（0：非侮辱，1：侮辱） 63 #引入float强制转换是使结果为小数 64 pAbusive = sum(trainCategory)/float(numTrainDocs) 65 #初始化为数据集列大小的单位矩阵 66 #p0Num：非侮辱性矩阵，p1Num：侮辱性矩阵 67 p0Num = np.ones(numWords); p1Num = np.ones(numWords) #change to ones() 68 #使np.log > 1，防止np.log分母为0而无法计算 69 70 #防止分母为0。因为计算每个子项概率采用的对数log（防止下溢出），是以2为底的，如果pADDenom = 2.0，则避免了分母为0的可能。 71 p0Denom = 2.0; p1Denom = 2.0 #change to 2.0 72 #遍历数据集每一行 73 for i in range(numTrainDocs): 74 #如果标签类中该行定义为侮辱性标签 75 if trainCategory[i] == 1: 76 #将数据集中指定侮辱性行对应数据迭代求和，结果还是矩阵 77 #统计数据集中指定侮辱性行存在的词语（为1），并求和，结果是数字 78 p1Num = trainMatrix[i] 79 p1Denom = sum(trainMatrix[i]) 80 #如果标签类中该行定义为非侮辱性标签 81 else: 82 #将数据集中指定非侮辱性行对应数据迭代求和，结果还是矩阵 83 p0Num = trainMatrix[i] 84 #统计数据集中指定非侮辱性行存在的词语（为1），并求和，结果是数字 85 p0Denom = sum(trainMatrix[i]) 86 #这里有个假定前提，每一行词语是相互独立的，也就有 87 #p(w/c1) = p(w0,w1,w2...wn/c1) = p(w0/c1)*p(w1/c1)*p(w2/c1)***p(wn/c1) 88 #计算数据集中侮辱性词语概率p(w/c1) 89 #取对数是防止下溢出，由于概率因子都非常小，当计算乘积p(W0/Ci)*p(W1/Ci)*p(W2/Ci)...*p(Wn/Ci)时，得到结果会更小， 90 #四舍五入会为0，所以采用log(a*b) = log(a) log(b) 91 p1Vect = np.log(p1Num/p1Denom) #change to log() 92 #计算数据集中非侮辱性词语概率p(w/c0) 93 p0Vect = np.log(p0Num/p0Denom) #change to log() 94 95 return p0Vect,p1Vect,pAbusive 96 ''' 97 输入：vec2Classify（测试文档（0.1向量）），p0Vec（非侮辱性概率训练参数）， 98 p1Vec（侮辱性概率训练参数），pClass1（标签类中侮辱性标签概率） 99 功能：比较侮辱性和非侮辱性后验概率，判断测试文档所属类别 100 朴素贝叶斯公式：p(Ci/W) = p(W/Ci)p(Ci)/p(W) 101 输出：1：侮辱性文档 0：非侮辱性文档 102 ''' 103 def classifyNB(vec2Classify, p0Vec, p1Vec, pClass1): 104 #计算文档属于侮辱性标签概率p(c1/w) 105 #np.log是以2为底，求和实际是相乘 106 p1 = sum(vec2Classify * p1Vec) np.log(pClass1) #element-wise mult 107 #计算文档属于非侮辱性标签概率p(c0/w) 108 p0 = sum(vec2Classify * p0Vec) np.log(1.0 - pClass1) 109 if p1 > p0: 110 #u"侮辱文档" 111 return 1 112 else: 113 #u"非侮辱文档" 114 return 0 115 116 #输入：列表集合（唯一），输入集合（文档或词汇表） 117 ''' 118 功能：检查输入集合单词是否在列表集合中，在则在列表集合对应位置加1 119 如果一个词在文档中出现不止一次，这可能意味着包含该词是否出现在文档中所不能表达的某种信息， 120 称为词袋模型(bags-of-words model)。在词袋中，每个单子可以出现多次，而在词集中，每个词只能出现一次。 121 ''' 122 #输出：向量列表（统计输入文档中每个单词在词汇样本中个数） 123 def bagOfWords2VecMN(vocabList, inputSet): 124 returnVec = [0]*len(vocabList) 125 for word in inputSet: 126 if word in vocabList: 127 returnVec[vocabList.index(word)] = 1 128 return returnVec 129 130 #测试（过滤网站恶意留言） 131 def testingNB(): 132 #获取数据集（数组），标签列表 133 listOPosts,listClasses = loadDataSet() 134 #将数据集数组转化为内容唯一的数据集list 135 #创建一个包含所有原始数据集词语集合，这个列表中词语不重复。 136 myVocabList = createVocabList(listOPosts) 137 trainMat=[] 138 #遍历数据集中每一行数组，将词语转化为向量0,1（1：该行数据中词语在myVocabList存在） 139 #词语文档 => 向量文档 140 for postinDoc in listOPosts: 141 trainMat.append(bagOfWords2VecMN(myVocabList, postinDoc)) 142 #计算分类器训练参数 143 p0V,p1V,pAb = trainNB0(np.array(trainMat),np.array(listClasses)) 144 #测试1 145 testEntry = ['love', 'my', 'dalmation'] 146 #词语文档 => 向量文档 147 thisDoc = np.array(bagOfWords2VecMN(myVocabList, testEntry)) 148 #结果分类 149 print (testEntry,'classified as: ', u"0 （非侮辱文档）" if(classifyNB(thisDoc,p0V,p1V,pAb) == 0) else u"1（侮辱文档）") 150 #测试2 151 testEntry = ['stupid', 'garbage'] 152 #词语文档 => 向量文档 153 thisDoc = np.array(bagOfWords2VecMN(myVocabList, testEntry)) 154 #结果分类 155 print (testEntry,'classified as: ', u"0 （非侮辱文档）" if(classifyNB(thisDoc,p0V,p1V,pAb) == 0) else u"1（侮辱文档）") 156 157 158 #输入：文本字符串 159 ''' 160 功能：文本处理，过滤掉一些不需要的字符（?，&，=...）以及URL中en和py这样的单词， 161 并全部转换为小写 162 ''' 163 #输出：处理后的字符串集合 164 def textParse(bigString): #input is big string, #output is word list 165 import re 166 #分隔符是除单词、数字外的任意字符都是分隔符 167 #string.split()只是以" "分隔 168 #正则匹配 169 listOfTokens = re.split(r'\W*', bigString) 170 #过滤掉少于2个字符的字符串，并全部转换为小写 171 return [tok.lower() for tok in listOfTokens if len(tok) > 2] 172 173 #测试（过滤垃圾邮件） 174 #说明：50封邮件中随机选取10封作为测试样本，剩下40封作为训练样本 175 def spamTest(): 176 docList=[]; classList = []; fullText =[] 177 #email文件下26封正常邮件，26封垃圾邮件 178 for i in range(1,26): 179 #准备数据，文本预处理 180 wordList = textParse(open('email/spam/%d.txt' % i).read()) 181 #保存为list（list递增二维） 182 docList.append(wordList) 183 #保存为array（扩展一维） 184 fullText.extend(wordList) 185 #标记邮件类别，垃圾邮件 186 classList.append(1) 187 #准备数据，文本预处理 188 wordList = textParse(open('email/ham/%d.txt' % i).read()) 189 #保存为list（list递增二维） 190 docList.append(wordList) 191 #保存为array（扩展一维） 192 fullText.extend(wordList) 193 #标记邮件类别，正常邮件 194 classList.append(0) 195 #将数据集数组转化为内容唯一的数据集list 196 #创建一个包含所有原始数据集词语集合，这个列表中词语不重复。 197 vocabList = createVocabList(docList)#create vocabulary 198 #python3.x range返回的是range对象，不返回数组对象 199 trainingSet = list(range(50)); testSet=[] #create test set 200 #随机选取10封邮件作为测试数据 201 for i in range(10): 202 #在50封邮件中随机抽选 203 randIndex = int(np.random.uniform(0,len(trainingSet))) 204 #保存list中 205 testSet.append(trainingSet[randIndex]) 206 #选取并保存后，去除该邮件对应的索引 207 del(trainingSet[randIndex]) 208 trainMat=[]; trainClasses = [] 209 #剩余40封邮件作为训练样本，训练分类器参数 210 for docIndex in trainingSet:#train the classifier (get probs) trainNB0 211 #将处理后的文本转化为词向量（词袋模型），并保存 212 trainMat.append(bagOfWords2VecMN(vocabList, docList[docIndex])) 213 #保存对应标签 214 trainClasses.append(classList[docIndex]) 215 #训练，获取最终训练参数 216 p0V,p1V,pSpam = trainNB0(np.array(trainMat),np.array(trainClasses)) 217 218 errRate = 0.0;iterNumber = 20 219 #迭代20次 220 for i in range(iterNumber): 221 errorCount = 0 222 #遍历测试数据集 223 for docIndex in testSet: #classify the remaining items 224 #将处理后的测试数据转化为词向量（词袋模型），并保存 225 wordVector = bagOfWords2VecMN(vocabList, docList[docIndex]) 226 #将训练后的参数导入分类器，输入测试的词向量，与测试数据对应标签比较，统计错误率 227 result = classifyNB(np.array(wordVector),p0V,p1V,pSpam) 228 if result != classList[docIndex]: 229 errorCount = 1 230 # print ("docIndex:%d,classification error:%s"%(docIndex, docList[docIndex])) 231 print ("docIndex:%d,classification error, predict result: %d mark class result %d:"%(docIndex, result, classList[docIndex])) 232 #每次错误率 233 print ('the error rate is: ',float(errorCount)/len(testSet)) 234 errRate = float(errorCount)/len(testSet) 235 #平均错误率 236 print ("the mean error rate is:", float(errRate)/iterNumber) 237 238 #return vocabList,fullText 239 240 241 #输入：vocabList（去重词汇表），fullText（未去重所有单词） 242 ''' 243 功能：计算高频词汇。遍历词汇表中每个词并统计它在文本中出现的次数，然后根据出现次数从高到低对词典进行排序, 244 最后返回排序最高的30个单词。 245 ''' 246 #输出：按降序排列的前30个单词以及单词对应出现次数 247 def calcMostFreq(vocabList,fullText): 248 import operator 249 freqDict = {} 250 #遍历词汇表中每个单词，统计每个单词出现的次数，然后以键值对保存 251 for token in vocabList: 252 freqDict[token]=fullText.count(token) 253 #以单词出现次数倒叙排列 254 sortedFreq = sorted(freqDict.items(), key=operator.itemgetter(1), reverse=True) 255 #返回前30个键值对对象 256 return sortedFreq[:30] 257 258 #输入：feed1（RSS1源），feed0（RSS0源） 259 ''' 260 功能： 261 1 根据朴素贝叶斯公式生成分类器; 262 2 判断随机抽选测试数据属于源RSS0或者RSS1; 263 3 计算分类错误率； 264 ''' 265 #输出：vocabList（词汇表），p0V（源RSS0概率），p1V（源RSS1概率） 266 def localWords(feed1,feed0): 267 # import feedparser 268 docList=[]; classList = []; fullText =[] 269 #获取源RSS0,RSS1最小行大小 270 minLen = min(len(feed1['entries']),len(feed0['entries'])) 271 for i in range(minLen): 272 #文本处理 273 wordList = textParse(feed1['entries'][i]['summary']) 274 #保存list（二维） 275 docList.append(wordList) 276 #保存array(一维) 277 fullText.extend(wordList) 278 #添加标签 279 classList.append(1) #NY is class 1 280 #文本处理 281 wordList = textParse(feed0['entries'][i]['summary']) 282 #保存list（二维） 283 docList.append(wordList) 284 #保存array(一维) 285 fullText.extend(wordList) 286 #添加标签 287 classList.append(0) 288 #生成词汇表 289 vocabList = createVocabList(docList)#create vocabulary 290 #获取词汇表中单词在文本中出现次数，并截取排名前30键值对 291 top30Words = calcMostFreq(vocabList,fullText) #remove top 30 words 292 #去除词汇表中排名前30单词 293 for pairW in top30Words: 294 if pairW[0] in vocabList: vocabList.remove(pairW[0]) 295 #RSS0 RSS1 296 trainingSet = list(range(2*minLen)); testSet=[] #create test set 297 #随机选取20作为测试数据，保存，然后在训练集中去除 298 for i in range(20): 299 randIndex = int(np.random.uniform(0,len(trainingSet))) 300 testSet.append(trainingSet[randIndex]) 301 del(trainingSet[randIndex]) 302 trainMat=[]; trainClasses = [] 303 #除去20个测试数据，剩下作为训练数据 304 for docIndex in trainingSet:#train the classifier (get probs) trainNB0 305 trainMat.append(bagOfWords2VecMN(vocabList, docList[docIndex])) 306 trainClasses.append(classList[docIndex]) 307 #生成分类器，获取训练参数结果 308 p0V,p1V,pSpam = trainNB0(np.array(trainMat),np.array(trainClasses)) 309 errorCount = 0 310 #计算测试分类错误率 311 for docIndex in testSet: #classify the remaining items 312 wordVector = bagOfWords2VecMN(vocabList, docList[docIndex]) 313 if classifyNB(np.array(wordVector),p0V,p1V,pSpam) != classList[docIndex]: 314 errorCount = 1 315 print ('the error rate is: ',float(errorCount)/len(testSet)) 316 return vocabList,p0V,p1V 317 318 #输入：ny（源RSS0）,sf（源RSS1） 319 #功能：根据贝叶斯公式，通过训练分类器获得的分类概率，找到排名靠前的单词。 320 #输出：RSS0和RSS1出现频率排名靠前的单词 321 def getTopWords(ny,sf): 322 # import operator 323 #获取训练样本词汇表，以及RSS0,RSS1的概率 324 vocabList,p0V,p1V=localWords(ny,sf) 325 topNY=[]; topSF=[] 326 #设置概率阈值，保存满足条件的键值对 327 for i in range(len(p0V)): 328 if p0V[i] > -6.0 : topSF.append((vocabList[i],p0V[i])) 329 if p1V[i] > -6.0 : topNY.append((vocabList[i],p1V[i])) 330 #RSS0最终结果排序 331 sortedSF = sorted(topSF, key=lambda pair: pair[1], reverse=True) 332 print (u"RSS0最终结果排序") 333 #打印RSS0频率最高词汇 334 for item in sortedSF: 335 print (item[0]) 336 #RSS1最终结果排序 337 sortedNY = sorted(topNY, key=lambda pair: pair[1], reverse=True) 338 print (u"RSS1最终结果排序") 339 #打印RSS1频率最高词汇 340 for item in sortedNY: 341 print (item[0])

测试文件：testMyBayes.py

1 # -*- coding: utf-8 -*- 2 """ 3 Created on Mon Nov 5 14:08:32 2018 4 5 @author: weixw 6 """ 7 8 import myBayes as mb; 9 import feedparser as fp 10 11 #过滤网站恶意留言 12 mb.testingNB(); 13 14 #过滤垃圾邮件 15 mb.spamTest() 16 17 18 ny = fp.parse('http://www.people.com.cn/rss/politics.xml') 19 length = len(ny['entries']) 20 21 sf = fp.parse('http://www.people.com.cn/rss/world.xml') 22 length = len(ny['entries']) 23 24 #vocabList,pSF,pNY = bs.localWords(ny,sf) 25 26 #找到排名靠前的单词 27 mb.getTopWords(ny,sf);

测试运行结果

1. 过滤侮辱文档

由给定的标签类可以看出，预测分类结果是正确的。

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