南红在古代不仅仅是配饰，古人用之入药，养心养血。在中国古代可用作药材之风盛行于三国魏晋南北朝时期，这一时期出土南红器极少，只产于云南保山一地。古人追求炼丹术，已达到长生不老，而南红玛瑙看似由无数的朱砂点汇聚而成，在古人眼中为神化的东西。
到了明代，当时著名医学家李时珍在《本草纲目》中记载：“玛瑙屑甘平、无毒，主治胃中热，喘息烦满，止渴，屑如麻豆服之，久服轻身延年。润心肺，助声喉，滋毛发。滋养五脏，止烦燥”。有一定药效。《神农本草经》卷一中也确有记载，它说南红玛瑙泉（即玛瑙屑汁）可以“柔筋强骨，安魄魄，长肌肉，益气。久服耐寒暑，不饥渴，不老神仙，人死服五斤，死三年色不变”。
现在根据仪器检测南红确实含有可被人体吸收的微量元素，如：铁、锌、硒、铜、铬、钴、镍和锰等。长期佩戴，可浸润皮肤，进入人体，补充不足，所以佩戴南红可使人体各项生理机能获得平衡，有稳定精神和镇定情绪的作用。
中医倡导头凉脚温。制成南红玛瑙枕，由数十片小南红玛瑙镶嵌而成，舒适透气凉爽，具有静电磁场，枕之入睡，头部十余穴处，即可按摩。
南红经过琢磨后，会产生一种特殊的光电效应，与人体发生谐振，形成微小的电磁尝能够与人体产生谐振，使诸器官协调运转，稳定情绪，集中精力，从而起到稳定情绪、增强反应能力、集中注意力的奇妙功效；制成手串，佩戴手腕，则有按摩功效，可蓄元气、养精神。
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