呵呵，这个春节基本和zotero较劲去了，不得不说它是一款我喜欢的文献管理软件为啥要用文献管理软件？整理文献及写文章的时候输出特定格式的参考文献，我来为大家讲解一下关于用zotero 怎么导入硕博论文?跟着小编一起来看一看吧!
用zotero 怎么导入硕博论文
呵呵，这个春节基本和zotero较劲去了，不得不说它是一款我喜欢的文献管理软件。为啥要用文献管理软件？整理文献及写文章的时候输出特定格式的参考文献。
整理文献：导入参考文献后，可以建立多个分类把参考文献分到不同类别中，方便查阅。看文献的时候还可以写笔记。点击参考文献的条目，右边有个专门做笔记的地方。做的笔记可以用zotero的高级搜索功能对笔记的内容进行检索，做的笔记得对应到某个文献条目下。
我把两种来源的水稻克隆基因相关的参考文献导入到了zotero中。一是:funricegenes(https://funricegenes.github.io/reference.table.txt).这个网站的维护团队还比较靠谱，能够进行持续更新。通讯作者是河南农大的。相关参考文献:Huang, F., Jiang, Y., Chen, T. et al. New Data and New Features of the FunRiceGenes (Functionally Characterized Rice Genes) Database: 2021 Update. Rice 15, 23 (2022). https://doi.org/10.1186/s12284-022-00569-1.这个网站提供的文献信息表结构是:Title Year Journal Affiliation Abstract Gene。所以通过这个表可以建立克隆基因和参考文献间的对应关系。这个表处理一下可以导入zotero中。怎么处理？awk -F "\t" '{print "TY - JOUR\n""TI - "$1"\n""PY - "$2"\n""T2 - "$3"\n""AB - "$5"\n""KW - "$6"\n"}' 2023_1_22_reference.table1.txt >fungenesref2023.RIS。基因名会出现在参考文献条目的"标签"中，zotero的高级搜索功能可以对标签进行检索。但导入的东西并不能直接输出为可以引用的参考文献，因为缺少一些必要信息。要改进的话，建议再加两个字段，1是pubmed id,2是DOI.这样的话用起来也许更方便。
二是:oryzabase(https://shigen.nig.ac.jp/rice/oryzabase/download/reference)。这个文件的结构是这样的:Reference_id,PubMedId,Author,Title,Journal,Volume,Pages,Year,CGSNL Gene Symbol,Gene Symbol Synonym.可以用这个命令生成可导入zotero的RIS格式文件。awk -F "\t" '{print "TY - JOUR\n""TI - "$4"\n""PY - "$8"\n""J2 - "$5"\n""L1 - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/"$2"\n""KW - "$9"\n""AU - "$3"\n""VL - "$6"\n""SP - "$7"\n"}' Reference_20230122165929.txt >oryzaref2023.RIS。基因名信息同样会出现在参考文献条目的"标签"中。这个导入文件非常大，总共有2万多个记录。这里面可能是所有和水稻相关的文章。这也是个在持续更新的网站。这个文件里提供了PubMedid信息，所以它还有另外一种导入的方法。利用R包sqldf,rentrez,XML和Pubmedid信息，生成可以导入zotero的xml格式的文件。目前，我的方法中，只能导入参考文献的信息，但相应基因的信息并没有加入，怎么把基因的信息加入到这个xml文件中?还不会。
三:NCBI的Bibliography和网collections可以和zotero较好的相互交流。即可以相互导入文献库。NCBI的Bibliography好像缺少格式化输出功能(也许是我没发现)，这个zotero可以提供。
这个软件还有个相应的网络版本，建立账号后本地版本的数据和网络数据可以同步，这也是个不错的功能。
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