兰花根部正常的颜色是黄色、淡黄色、黄白色的，也有褐色和浅褐色，这些根系都能正常地从植料里面获取养分和水分。
兰花根部变黑腐烂最典型的就是茎腐病，茎腐病属于真菌性病害，可从叶片侵入，也能从根系侵入，常常最先感染假鳞茎，然后通过假鳞茎向叶片和根系扩散，最显著的特点是感染部位发黑，刚开始根系还是黑硬的，过段时间根系里面的组织坏死就会腐烂，然后空根，黄叶，倒苗。
兰花发生茎腐病的原因是采用了黏性较大或过细的植料时，根部就容易积水，水分会把盆内的空气排出，并隔绝了根系与空气的接触，兰花的根系得不到呼吸就会迅速坏死，并腐烂发黑。
茎腐病预防方法：避免高热高湿环境，特别要注意养兰地点的通风，实在不行就配风扇。定期进行杀菌，常用杀菌药有多菌灵、百菌清、甲基托布津，防大于治。使用透气性好、排水快的植料来种植兰花，细植料以及含土较多的要减少浇水次数，将兰花放置在阴凉通风的环境。
另外多注意观察，当根部的表皮突然发黑了，其实里面并没有腐烂。这时候抢救还来得及。方法是一个是喷药，加强通风，避免阳光和高温，如果是有积水的必须果断地翻盆、修根、换半干料重新种植。
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