乡镇党委政府机关设置为行政机构，包括党委、政府、人大、政协机关办公室，以及纪委、武装部等，使用行政编制，工作人员为公务员身份。除此之外，其他都是事业机构，使用事业编制。
乡镇事业单位包括农业服务中心、农经服务中心、社会事务中心、文化服务中心、公共卫生服务中心，以及财政所、司法所、食药所、国土所、工商所、林业站、水利站、畜牧站、乡镇卫生院，以及派出所、税务分局、运管、交警等，有的归乡镇党委政府管理，有的归县局管理，有的为派出机构，各地管理、权属不一，实际设置比较复杂。
乡镇事业单位中，有乡镇政府管理的，有县局垂直管理的；有统一设置的，有单独设置的；有几个乡镇综合设置的，有每个乡镇统一设置的；有全额供给的，有自收自支的。随着乡镇机构改革以及部门垂直改革，机构设置混乱，隶属关系混乱，名称职能混乱，人员编制混乱，给乡镇人事管理和经济发展造成了极大的不变。
随着新一轮党政、事业改革，乡镇党委政府及事业单位改革也将统筹规划，同步推进。多地试行乡镇事业单位设置“2 1”模式，即成立统一的乡镇政务服务中心、行政执法中心和综合服务中心，统一管理便民服务、行政执法和社会服务事项，统一由乡镇党委政府协调管理，县局只负责业务指导。
