《海上牧云记》讲诉了端朝末年，牧云皇族和穆如世家三百年的盟约因为一个预言而冰裂。预言说，六皇子牧云笙（黄轩饰）执剑则天下大乱，而穆如寒江（窦骁饰）将成为未来的皇帝。以牧云栾（王千源饰）和牧云德（张晓晨饰）为代表的地方势力密谋趁机夺权，为此不惜与邪恶势力合作。太子牧云笙不爱江山不信天命，为追寻真爱宁愿牺牲权力地位。
一直被软禁在宫中，所有的人都远离他，畏惧他。逃避一切，对一切都漠不关心，独处于王权之外，不愿身边任何人受到伤害一直躲避，前期一直处于出生的状态，直到遇到穆如寒江和盼兮，可是盼兮什么都没有做却因此受到牵连，至此他才去拿起权利和武器争夺，只因想保护想保护的人。
穆如寒江（窦骁饰）
穆如寒江生于官宦世家，长与市井之地端朝大将军穆如槊之子本应生活无忧衣食不愁。但不幸的是他的星命显示他将是大端王朝下一任的帝王，终将一呼百应。为了保全穆如寒江的性命，也维持世间的太平，其父大将军穆如槊在他一出生后就将他遗弃街头。
在艰难环境下成长起来的穆如寒江被磨练成了一个性格强悍，好勇斗狠的少年。却依旧善良隐忍，在其12岁的时候，穆如寒江被其父暗中派去的老师穆如元收做徒弟，教其武功与阵法并赠予穆如传家宝剑寒彻剑。本领过人的穆如寒江也成为了药王庙一带数十少年的领头人。但他内心却是寂寞与单纯的，虽然表面不在乎，甚至抵触自己的身世，但事实上非常想了解，总觉得心里空落落的，不知道自己到底是谁，来世上究竟要做什么。他的命运在遇到星命注定为皇后的苏语凝后发生了巨大的转折。
硕风和叶（周一围饰）
硕风主君继承人，铁沁硕风和叶是瀚州北部硕风部的主君继承人。他原本是个善良、单纯、豪迈、勇武的少年。深受族文化影响，帮助他人，却引来灭族之灾，硕风和叶的母亲龙格丹朱希望他可以成为硕风部的族长，带领族人在草原世代生存下去，让硕风的血脉在瀚北延续。
而硕风和叶骨子里却带着放荡不羁，内心充满了远大的理想，总是想去到那些没有去过的地方看看，想去了解草原外的广阔九州世界。也正是他的好奇心，使得他为自己、为家庭、为族人带来了灾难。他带回部落的算命僧预言了九州的命运，道出了牧云家族和穆如家族极力隐瞒的秘密，致使整个部落遭到了穆如铁骑的屠杀。也在他的心中埋下了对于两个家族的仇恨，对于权贵氏族的仇恨。而硕风和叶从不畏惧权势，从不知道害怕。他是打不到杀不死的，他要恢复硕风部的英名和满足的荣耀，让硕风部不再任人宰割。
三个都是星命所预言的帝王，三个相遇相识相知相杀，谁更适合做一代帝王呢？看九州繁华，谁主沉浮？
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