《神雕侠侣》中的男主角杨过，前期可以说对全真教是恨之入骨。
只是殊不知如果没有全真教的人，他可能都没有机会降生。
杨过从小没有见过父亲，由母亲穆念慈抚养长大。
穆念慈在杨过十一岁时染病身亡，之后杨过一直流落江湖，直到碰上郭靖黄蓉夫妇被带回了桃花岛。
因为私下练习欧阳锋教给他的蛤蟆功打伤了大武小武，又和郭靖师傅柯镇恶发生了矛盾，
郭靖无法，只得听从黄蓉的建议，把杨过送到了全真教学艺，谁知杨过在全真教过得也不好。
原来郭靖和杨过在去重阳宫的路上，碰到了全真教第三代弟子。
这些弟子不分青红皂白，就诬赖郭靖是淫贼，还和郭靖动上了手。
自然被郭靖打的是落花流水，这样一来，全真教自然是颜面扫地。
尽管后来丘处机出来澄清误会，可是对于赵志敬这样的小人，仇恨怎么会轻易消除。
郭靖他们打不过，杨过总可以欺负吧。
就这样赵志敬他们，开始拿杨过出气。
杨过在全真教每天像奴隶一样干苦力，换来的只是赵志敬、鹿清笃这些全真教道士的欺凌打骂。
在这样的情况下杨过当然会恨全真教。
只是早在射雕中，全真七子中的清静散人孙不二，就救过杨过母亲的命。
《射雕英雄传》连载版中，杨过的母亲是秦南琴。
秦南琴是一名捕蛇女，从小和爷爷相依为命。
郭靖跟黄蓉分开后，借宿到秦家，路见不平救了秦南琴和她爷爷。
秦南琴对郭靖也是心生好感，只是郭靖早已心有所属，心中只有黄蓉一人。
等到秦南琴见到黄蓉，自觉不如黄蓉，便没有对郭靖表明心意。
郭靖离开后，秦南琴爷爷被人杀害，秦南琴也被铁掌帮抓去献给杨康。
杨康在被穆念慈拒绝后，因为得不到穆念慈，心生恨意，转头将秦南琴玷污了。
这一切都被站在窗外的穆念慈看在眼里，
穆念慈见未婚夫杨康，如此禽兽不如，悲痛欲绝独自下了铁掌峰。
经过这事，穆念慈对杨康心如死灰，只想一死了之，黑暗中闯入了一所道院。
只见墙上挂着一位道长画像，旁边提着“活死人”三个字，穆念慈虽然不明白什么意思，只是想到自己此时如若死去，义父杨铁心和义母包惜弱的仇就不能报了。
当下请求院中的老道姑，收自己做了弟子。
事实上这家道观正是王重阳弟子孙不二的清修之地，穆念慈看到的画中之人正是中神通王重阳。
穆念慈虽然在道观住下，但是隔天就开始生病，病了几天，醒来之后发现站在床头的秦南琴
也是做道姑打扮。
原来秦南琴被杨康侮辱后，便想找机会报仇，就跟着杨康下了铁掌峰。
本想在悬崖上跟杨康同归于尽，谁知杨康掉落悬崖反而捡到了《武穆遗书》。
秦南琴趁杨康看书没注意的时候，从外面找了条毒蛇放在杨康身边。
杨康被毒蛇咬了一口，觉得自己性命难保，让秦南琴将书交给完颜洪烈
秦南琴恨极了杨康，怎么可能照做，知道杨康心疼武穆遗书，当着杨康的面 把书撕了十多张。
秦南琴准备杀杨康的时候，外面来了欧阳克的蛇奴。
秦南琴害怕被她们抓住，赶紧跑了出去。
谁知阴差阳错也跑到了孙不二的道院，看到穆念慈病的厉害，就留下来照顾穆念慈。
跟穆念慈学着求孙不二收自己为徒。
之后在铁枪庙杨康打了黄蓉一掌，正好打在软猬甲上。
软猬甲之前又被南希仁打过，上面还残留着欧阳锋的蛇毒，兜兜转转杨康死在蛇毒之下。
穆念慈看杨康死去，自己也殉情随杨康去了。
反倒是秦南琴生下了杨康的孩子。
郭靖不放心她一个人，将马钰传授给他的内功心法，教给了秦南琴一些。
秦南琴将武穆遗书交给了郭靖。
射雕中的秦南琴，性格刚硬，有仇必报。
相信如果不是走进道观，被孙不二开导，估计在给自己报仇后，可能就自杀而死了。
这样自然不会再有杨过什么事了。
而在《神雕侠侣》连载版中，也特意提到了这事。
杨过在重阳宫找到小龙女后，执意要在重阳祖师座前拜堂成亲。
表示要为林朝英争一口气，全真教的人自然不愿意。
一番交手，杨过挟持了孙不二。
杨过进到内堂，对王重阳的的画像看了几眼。
画中道人三十来岁年纪，肖像旁题着“活死人”三个字。
书上之后说，其中还有一个细节，杨过却从来不知。
若不是有这幅王重阳画像和孙不二，世上压根就没有杨过这人。
二十年前，杨过之父杨康行止不端侮辱了秦南琴，杨康未婚妻子穆念慈为此和他反目。
秦穆二女伤痛之下，各怀死志，却在铁掌峰山的一所道院之中，先后见到这幅画像。
这道院正是孙不二所居，她习静清修，慈悲为怀。
一听说二女都是为了男女之事而准备自尽，于是也不追问详情，将二人收留了下来。
秦南琴当日如不是，见到画像上“活死人”三字而心有所悟，估计会立即一死了之。
那么自然不会再生下杨过，更不会将他抚养长大了。
又说孙不二一生中救人无数，早就不将此事放在心上。
哪知道眼前这个少年，竟和当年这桩事有重大牵连。
杨过自己自然更不会知道，否则他岂敢对孙不二这么无礼。
要知道之前在陆家庄英雄大会上，杨过和金轮法王、达尔巴、霍都比武，向在场众人借剑。
孙不二递上自己的长剑，杨过当场拒绝，让孙不二下不了台。
如果杨过知道有这样的机缘存在，相信不会对孙不二如此无礼。
这是在连载版中的剧情，在之后的三联版和世纪新修版中。
金庸先生删除了秦南琴的戏份，穆念慈的结局也做了更改，并没有随杨康殉情反而生下了杨过。
不过穆念慈在铁掌峰上，听到了杨康和裘千仞密谋叛国，狠狠打了杨康一巴掌，独自一人跑下了铁掌峰。
之后如连载版中一样，闯进了一所道院，被一个老道姑给救了下来，这里并没有提到王重阳的画像。
在之后三联版和世纪新修版中，也没有提到孙不二救穆念慈的事情。
金庸先生似乎是想把秦南琴删除得一干二净，又不想杨过和全真教有瓜葛。
父亲杨康虽然受过全真教的恩，但是在儿子杨过这里也还给全真教了。
不过全真教和杨过一家渊源太深了，单看孙不二救秦南琴和穆念慈这件事，全真教对杨过就有再生之恩。
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