有人认为这是因为我们的脑中会分泌褪黑激素这种睡眠荷尔蒙、加深睡眠，而加深睡眠的时机又与闹钟响的时间重叠的关系。毕竟深度睡眠（非快速动眼期睡眠）时的脑波就算接受闹钟声音的刺激也不会产生任何变化，导致位于下视丘前方的睡眠中枢和位在后方的清醒中枢很难彼此切换。这种情况多数发生在睡眠时间很短就要起床的时候。
此外，体质容易残留褪黑激素在脑中（即褪黑激素很难降下）的人，建议可以拉开窗帘，让阳光照亮整个室内。
有趣的是，能够顺利在清醒和睡眠之间切换的人，也很善于切换自己内心的情绪，不会愁眉不展的烦恼，也不会放不下后悔的心情。可以说，他们是决定要做就会去做，很擅长命令自己的人。
大脑在迈出“最初的一步”时，会消耗大量的能量。因此即使是“离开被窝”这个乍看之下很简单的动作，也会给大脑带来庞大的负担。尤其是平常就没什么精神的人，或是在疲劳堆积于身的时候，光是起床就让人累得不行。于是导致大脑形成无法运作的状态，进而变得“更起不来”。
以脑区来看，并非睡眠不足，但早上却起不来的人，其较弱的区块是左脑的思维系统。因为这里是负责对自己下达命令，打开行动开关的区块，所以可以透过具体描述起床目的的言语来锻炼这个部分。另外，脚底穴位按摩也颇有良效。
同时，也要去触及运动系统。张开眼睛的时候伸个懒腰，或是只坐起上半身，像这样决定一些小小的行动，并写在纸上、贴到卧室墙上。哪怕仅仅一个动作，也能刺激到运动系统。这种设置低矮门槛来激励大脑的方法，称为“一小步”或“小行动”，目前也被运用在教练指导或心理辅导上。
想要让自己听到闹钟后顺利起床，就要通过触及思维、运动系统，来唤醒你的大脑。
1. 思维系统
比如告诉自己“现在起床，就能及上班/上学”。
2. 运动系统
如前面所说，哪怕只有上半身起来也好。
