除了主教座堂外，还去了另一座教堂，圣多马教堂 (法语：Église Saint-Thomas, 德语：Thomaskirche），或圣托马斯教堂。这是斯特拉斯堡最主要的新教教堂。
教堂的历史可追溯到6世纪，因使徒多马而得名。现在的教堂是在最早教堂的基础上，于1196年重建的，教堂完工于1521年，历时三百余年，外观还是罗曼式，但里面却是晚哥特式了。
1524年，教堂被改做为新教教堂，首任牧师就是马丁.布塞尔（Martin Bucer，也称马丁.布策，1491-1551）。加尔文流亡在斯特拉斯堡的三年中，正是跟从马丁.布塞尔学习，所以说马丁.布塞尔对加尔文主义乃至安立甘宗都影响很深。
教堂前的一些演出预告，新教教堂经常会用来搞些音乐会之类的演出。
这张文字说明上说，1778年10月26日，莫扎特曾弹奏过这架管风琴。
这就是莫扎特弹奏过的管风琴，制作于1741年，与主教座堂那架管风琴出自同一家，只不过大教堂的管风琴被后世“修复”的面目全非了。
教堂内部，还是很哥特的。
虽然是新教教堂，但天主教堂一些装饰并没有完全去除，不过主祭坛的位置是一个陵墓。陵墓的主人是路易十五的大元帅，莫里斯.萨克斯（Maurice de Saxe，1696-1750），波兰国王的私生子，法国历史上著名的大元帅之一。
大元帅有个孙女，是法国著名女作家，乔治.桑。乔治.桑有个著名的情人叫肖邦。
莫里斯元帅的中文介绍，由于莫里斯是位新教徒，所以路易十五特地下令将他葬在这里，并由皇家建筑师设计陵墓。
墙上残留的壁画，大概是米迦勒（因为有翅膀）。
很窄的侧廊。
