前情提要——深町晶等人对组织来说已经是个无法忽视的巨大威胁了,也是【克诺斯】在这个星球上唯一的威胁!巴卡斯将【卡巴】的所有相关资料在组织内全面公开,而资料上的数据令组织的科学家们下巴都惊掉了,无视能量定律,如此弱小的身躯竟能爆发出如此巨大的能量!?另一边,深町晶与瑞纪也与卷岛会合了,现在要带着他们前往大家的藏身处,竟是遗迹基地的最底层……!?
潜行进入到遗迹最底层后,哲郞向晶详细说了自己那天的遭遇,是村上并着性命配合卷岛潜入地下逃过了一劫。而竟意外的打通了遗迹基地最底层的一个水通道,来迎接他们的正是小田桐主任。接下来,小田桐主任也向晶等人讲述了村上曾经的遭遇……。紧接着吉欧就下到了最底层,虽然吉欧并没有发现他们,到最底层是有自己的目的,但却意外与试作体的村上产生了生体波动共鸣……!