封神大劫开启后，通天教主知道虽然截教表面上看起来实力强大，但是最顶层的战斗力——天道圣人数量上远不如阐教一方，阐教一方除了元始天尊外，还和太上老君交情极好，而且女娲娘娘也是站在了元始天尊一方；更令通天教主没想到的是，元始天尊还耗费了巨大代价请来了西方教的接引道人和准提道人两尊天道圣人。
这样一来，截教的胜算就更低了；不过阐教和截教从立教的时候，就表明了两派的对立立场，所以大道五十，天道四十九，为世间万物留一线生机。元始天尊立阐教成圣，阐述天道，也就是天道四十九的那个；而通天教主立截教成圣，表明的是为众生截取天道外的一线生机。
大战前，阐教就积极筹划，安排姜子牙等人下山辅佐西岐；而截教则一切按部就班，高层战力更是处于收缩状态；在战事开始后，阐教便以多欺少、倚强凌弱，阐教十二金仙早早的就加入了战场；但截教参战的大多是三四代弟子，最多也就一个外门大弟子赵公明和三霄娘娘而已，而且还给阐教带来了极大的困难。
但是随着战事的推进，尤其是三霄娘娘被元始天尊和太上老君无耻的杀害之后，通天教主也忍无可忍了，加上大弟子多宝道人的挑唆，通天教主最终决定截教全部加入抵抗阐教入侵的战役中；先是布下了诛仙剑阵，可惜被元始天尊、太上老君和接引道人、准提道人联手给破了；后又布下万仙阵，但终究不是敌手，加上长耳定光仙的出卖，截教完败。
此战中，通天教主损失惨重，麾下八大亲传弟子，仅无当圣母奉通天教主之命，在万仙阵中提前逃走了，为截教保留下来一份生机。而大弟子多宝道人则是被太上老君俘虏了，在太上老君化胡为佛的后，点化多宝道人为多宝如来。
而金灵圣母则是在与文殊广法天尊、普贤真人、慈航道人交手的时候，被燃灯道人用定海珠偷袭，当场命丧；后被封为坎宫斗姆，为星宿之首。龟灵圣母在追杀惧留孙的时候，被接引道人所擒，后被蚊道人吸尽浑身精血，三魂六魄重入轮回。
赵公明是被陆压道人用“钉头七箭书”所杀；三霄娘娘虽然战绩辉煌，但终究不是天道圣人的对手，被元始天尊和太上老君联手破了九曲黄河阵后，元神飞往了封神台。与八大亲传弟子相比，明显通天教主麾下的随侍七仙下场要好很多。
乌云仙是随侍七仙之首，法力也是最高强的，被西方教主准提道人六根清净竹钓去西方七宝林八德池，不过据说后来借太上老君化胡为佛之际，趁乱逃走了。而金箍仙在万仙阵后与无当圣母一起不知所踪，据说后来的“金箍、紧箍、禁锢”就是金箍仙所化。
而毗芦仙在万仙阵后归西方教，千年之后成毗卢遮那佛。长耳定光仙是截教的叛徒，在交战中献出通天教主的六魂幡，破坏万仙阵，投靠西方教后应为佛教定光欢喜佛。金光仙被慈航道人收为坐骑，虬首仙被文殊广法天尊收为坐骑，灵牙仙被普贤真人收为坐骑。
虽然结局不算太好，但是相比起八大亲传弟子来说，无疑要好很多，至少没战死后上封神榜；两人成佛，三人成坐骑，有一人虽然被擒，但后来侥幸逃脱，还有一人下落不明；不过总体来说，截教算是被毁了，即便重建，难度也是太大了。
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