山东大学和厦门大学都是华东地区具有一定的影响力的原985高校，现在是世界一流大学；两校在2021年软科大学排名也非常的接近；山东大学排在21名，厦门大学排在了26名。两校都是以文理学科见长的高校；两校的工科的发展都稍微差一点，这也是老牌以文理见长的高校面临的转型难题；按照现在的社会发展趋势，未来的高校比拼的都是理工医学科了。
在第四次学科评估中，山大的数学获得了A 的学科评级，这是理学皇冠学科的最高评级；在获得8个A类学科评级中只有A-的控制科学与工程学科是工科，其他7个学科都是分布在文理学科，厦门大学海洋科学也获得了A 的学科评级，在获得的7个A类学科评级中全部分布在文理学科上，在21个B 以上的学科里面也只有3个工科学科；可见厦大的学科建设方向更是偏向文理；当然两校也在积极做学科建设的转型工作；厦大今年获得的集成电路科学与工程的一级学科博士点；就是厦大学科转型的积极信号，山东大学是没有该交叉学科的首轮博士点。
在科研平台的建设上，山大建有晶体材料“”和“微生物技术”国家重点实验室，“燃煤污染物减排”和“电子商务交易技术”国家工程实验室和3个国家科研中心，13个部委级重点实验室，厦大建有固体表面物理化学、近海海洋环境科学、细胞应激生物学、分子疫苗学与分子诊断学国家重点实验室，醇醚酯化工清洁生产国家工程实验室，国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心；国家与部委级重点实验室10个。
在最近五年获得的国家三大奖上，山大和厦大基本又在同一水平上，山大五年内获得了国家自然科学二等奖一项，科技发明二等奖1项和科技进步二等奖3项，厦大获得了自科科学二等奖三项。至今两校没有以牵头人的身份获得有分量的一等奖，说明两校在理工科上行的压力是非常大的。在2021年全球高被引科学家数量上，厦大被高被引了8人次，山东大学被高被引了7人次；基本又是一个平手。
山大和厦大这两所双一流高校，在学科建设、科研平台、高被引论文数量与国家三大奖的数量上都是非常的接近的，基本处于同一层次的水平高校；厦门大学位于风景优美的厦门市，又以文理学科见长，很多考生都是奔着最美校园的厦大去了，毕竟美丽的校园对很多考生的吸引力还是非常大的，按照办学实力和优势学科数量，山东大学还是要稍微领先于厦大一点点的；厦大拥有的地域上优势抵消了学科建设上的差距。
