在养殖过程中，氨氮亚硝酸盐的问题会给广大养殖户带来很大的麻烦，而在降解氨氮、亚硝酸盐的过程中，大家也逐渐放弃传统的吸附沉底方式，喜欢使用生物方式，按生态的方法来解决此类问题。
使用生态的方法解决氨氮和亚硝酸盐的问题，我们就会用到这两种物质密切相关的硝化细菌和反硝化细菌。在常温下，硝化细菌和反硝化细菌繁殖一代的周期为12小时以上，所以我们建议在使用这两种细菌之前，首先经过一个活化过程。在这个过程中，建议活化时间为16小时。硝化细菌和反硝化细菌在繁殖和生长过程中，都会以亚硝酸盐为原料，分别转化为不同的物质，所以在活化的时候，建议我们要在活化的容器里加入氮源，其中最好的是氨氮、亚硝酸盐等可以直接被硝化菌和反硝化菌利用的物质，如果没有这些物质，在活化容器中加入少许尿素，会对这两种细菌的生长和繁殖有有很大的帮助。
由于硝化细菌是好氧菌，反硝化细菌有好氧菌也有厌氧菌。所以在活化过程中建议给菌液充气打氧，促进硝化细菌和好氧反硝化细菌的繁殖。
在使用硝化细菌和反硝化细菌之前，建议先对水体解毒，为硝化细菌和反硝化细菌营造一个舒适的水体环境，从而可以更好的发挥作用。
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