《游戏王GX》主角从原作的武藤游戏更换为游城十代 ，一些基础设定也焕然一新。与《游戏王－怪兽之决斗》是同一个世界，前作的登场人物也有数名登场，但是本作与前作剧情上并不衔接，而是创新。标题中GX是“Generation Next（下一代）”的缩写。整部动画分为七星篇、破灭之光篇、异次元篇、Darkness篇，全180集。
元素英雄新宇侠【主角卡】
元素英雄 新宇侠是游戏王卡片中的一张通常怪兽卡，卡名带有“英雄/HERO”、“元素英雄/E·HERO”、“新宇/ネオス”三个字段。新宇宙侠卡组的核心怪兽，跟不同种的新宇宙侠进行接触而融合出不同能力的融合怪兽。也能跟其他怪兽（如于贝尔、虹龙）合体成为强力的怪兽。是主角游城十代的后期卡组主力。被认为是日本特摄剧《奥特曼》系列中的奥特曼。
究极宝玉神虹龙
约翰所使用的宝玉兽卡组的王牌怪兽，也是我最喜欢的卡牌之一。约翰被于贝尔附身后，「究极宝玉神 虹龙」变成了黑暗形态。在原作中能和高等宝玉兽进行配合，收录后效果变更为与暗属性主题配合，一般情况下不能被宝玉兽卡组使用，但得到高等暗黑结界的强化后则能使用。因为「宝玉的守护者」和「宝玉的先导者」是收录于OCG卡包SECE(903)中的10张WP卡之一，使得宝玉兽系列进入灵摆召唤系统。
特殊召唤/效果：这张卡不能通常召唤。自己的场上·墓地有「宝玉兽」卡7种类存在的场合才能特殊召唤。这张卡特殊召唤的回合，这张卡的①②的效果不能发动。
①：把自己场上的表侧表示的「宝玉兽」怪兽全部送去墓地才能发动。这张卡的攻击力上升送去墓地的怪兽数量×1000。这个效果在对方回合也能发动。
②：从自己墓地把「宝玉兽」怪兽全部除外才能发动。场上的卡全部回到持有者卡组。
神炎皇 乌利亚
三幻魔之一，对应三幻神诞生出的神级怪兽卡，但由于其强大的黑暗力量无法驾驭，分别被设置了七条钥匙将其封印于决斗学园的七精门内。跟三幻神和三邪神一样，召唤条件都是使用场上3张表侧表示的卡作为代价，但三幻魔并非与前两者一样全部使用怪兽卡作为代价。
特殊召唤/效果：这张卡不能通常召唤。把自己场上3张表侧表示的陷阱卡送去墓地的场合才能特殊召唤。
①：这张卡的攻击力上升自己墓地的永续陷阱卡数量×1000。
②：1回合1次，以对方场上盖放的1张魔法·陷阱卡为对象才能发动。盖放的那张卡破坏。不能对应这个效果的发动让魔法·陷阱卡发动。
降雷皇 哈蒙
三幻魔之一，对应三幻神诞生出的神级怪兽卡，但由于其强大的黑暗力量无法驾驭，分别被设置了七条钥匙将其封印于决斗学园的七精门内。跟三幻神和三邪神一样，召唤条件都是使用场上3张表侧表示的卡作为代价，但三幻魔并非与前两者一样全部使用怪兽卡作为代价。
特殊召唤/效果：这张卡不能通常召唤。把自己场上3张表侧表示的永续魔法卡送去墓地的场合才能特殊召唤。
①：只要这张卡在怪兽区域守备表示存在，对方不能选择其他怪兽作为攻击对象。
②：这张卡战斗破坏对方怪兽送去墓地的场合发动。给与对方1000伤害。
幻魔皇 拉比艾尔
三幻魔之一，对应三幻神诞生出的神级怪兽卡，但由于其强大的黑暗力量无法驾驭，分别被设置了七条钥匙将其封印于决斗学园的七精门内。跟三幻神和三邪神一样，召唤条件都是使用场上3张表侧表示的卡作为代价，但三幻魔并非与前两者一样全部使用怪兽卡作为代价。
特殊召唤/效果：这张卡不能通常召唤。把自己场上存在的3只恶魔族怪兽作为祭品的场合才能特殊召唤。每次对方召唤怪兽，在自己场上特殊召唤1只「幻魔衍生物」（恶魔族·暗·1星·攻/守1000）。这些衍生物(TOKEN)不能进行攻击宣言。1回合1次，可以把自己场上的1只怪兽作为祭品，这个回合的结束流程前这张卡的攻击力上升祭品怪兽的原本攻击力的数值。
暗黑之召唤神
“ 三幻魔 ”的辅助卡，极其变态.....三幻神都没有这么强的辅助
效果：可以将这张卡做祭品，从自己墓地无视召唤条件特殊召唤「神炎皇 乌利亚」「降雷皇 哈蒙」「幻魔皇 拉比艾尔」。使用了这个效果的回合，自己不能攻击宣言。
混沌幻魔 阿米泰尔
由三幻魔融合召唤而来，真的是毫无颜值可言....
融合/效果：「神炎皇 乌利亚」 「降雷皇 哈蒙」 「幻魔皇 拉比艾尔」
把自己场上的上记卡除外的场合才能从额外卡组特殊召唤（不需要「融合」）。
①：这张卡的攻击力在自己回合的期间上升10000。
②：这张卡不会被战斗破坏。
尤贝尔 尤贝尔-被憎恶的骑士 尤贝尔-极度悲伤的魔龙
尤贝尔（NW翻译为「于贝尔」），前世原本是为了保护游城十代而主动接受改造的人类，后来幻化为决斗精灵伪装成卡片暗中保护十代。但年幼的十代察觉到尤贝尔的存在并因为其保护自己而诅咒别人的力量所以借助特殊的机会将其送入了太空，却使其受到了宇宙中邪恶的光之波动影响，变成了邪恶的决斗精灵。 后来与十代融合为一体，成为十代的背后灵。与十代融合后的尤贝尔个性与之前已截然不同，能感受十代的真实感受和情绪，充当着十代背后的支持者并给予他力量，从心里相信十代会战胜黑暗。
尤贝尔效果：
- 这张卡不会被战斗破坏
- 对方的怪兽攻击这张卡的话，攻击会反弹回去
- 回合结束需要把1只自己的怪兽解放，否则他会破坏
- 这张卡被不是这张卡的效果破坏的场合，可以从手牌墓地卡组特殊召唤「尤贝尔-被憎恶的骑士」
尤贝尔-被憎恶的骑士效果：
- 这张卡不能通常召唤。「尤贝尔」的效果才能特殊召唤
- 这张卡不会被战斗破坏，这张卡的战斗发生的对自己的战斗伤害变成0
- 场上表侧攻击表示存在的这张卡被对方怪兽攻击的场合，那次伤害计算前给与对方基本分攻击怪兽的攻击力数值的伤害
- 自己的结束阶段时，这张卡以外的场上的怪兽全部破坏
- 这张卡从场上离开时，可以从自己的手卡·卡组·墓地把1只「于贝尔-极度悲伤的魔龙」特殊召唤
尤贝尔-极度悲伤的魔龙效果：
- 这张卡不能通常召唤。「尤贝尔-被憎恶的骑士」的效果才能特殊召唤
- 这张卡不会被战斗破坏
- 这张卡的战斗发生的对自己的战斗伤害变成0
- 场上表侧攻击表示存在的这张卡和对方怪兽进行战斗的伤害步骤结束时，给与对方基本分对方怪兽的攻击力数值的伤害，那只怪兽破坏。
虹光新宇侠是「元素英雄新宇侠」和「究极宝玉神虹龙」或「究极宝玉神虹暗龙」的融合体，拥有把对方场上的怪兽、魔陷或墓地的卡片返回卡组的强大效果。各种让对面的卡回家的效果，求对面心理阴影面积...
效果·融合：「元素英雄新宇侠」 名字带有「究极宝玉神」的怪兽。这张卡用以上记的卡为融合素材的融合召唤才能特殊召唤。1回合1次，可以从以下效果选择1个发动。
- 通过把自己场上1只怪兽送去墓地，对方场上的怪兽全部回到卡组。
- 通过把自己场上1张魔法·陷阱卡送去墓地，对方场上的魔法·陷阱卡全部回到卡组。
- 通过从自己卡组上面把1张卡送去墓地，对方墓地的卡全部回到卡组。
这张卡是游城十代用「元素英雄新宇侠」和6只「 新宇宙侠」进行接触融合而来的最终王牌怪兽。
动画中的效果：把自己场上的1只「元素英雄 新宇侠」和自己的场上·墓地的6只卡名不同的名字带有「新宇宙侠」的怪兽回到卡组才能从融合卡组特殊召唤（不需要「融合」魔法卡）。选择自己的卡组的1只名字带有「新宇宙侠」的怪兽从游戏中除外，这个回合中得到除外的卡的怪兽效果。这个效果每把1张卡从游戏中除外，这张卡的攻击力上升500。
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