方济各会传播到欧洲各地后，引发了巨大的反应。许多底层百姓都热爱乐于助人，尤其是帮助穷苦大众的方济各会教士。阿西西作为方济各修道的场所和故乡也成为了宗教圣地。在此情况下，1228年起，教会决定在阿西西修建一座宏伟的大教堂。这座大教堂是圣方济各的下葬之地，也是方济各会的总堂。这座大教堂历时多年修建完成，共分为几大部分：上教堂、下教堂、安放圣方济各遗体的位于下教堂地下的墓穴和诸多附属修道院。
上教堂和下教堂还邀请了诸多当时著名艺术家前来绘制壁画，尤其以奇马布埃和乔托最为著名。
乔托为阿西西的圣方济各圣殿画的壁画更是大师之作，被誉为文艺复兴时代开始的标志。
上教堂的乔托壁画
Legend of St Francis：11. St Francis before the Sultan，1297-1300，Upper Church, San Francesco, Assisi
11.圣方济各在苏丹前接受火焰的考验方济各在阿拉伯苏丹面前传教，苏丹很生气，点起了一堆火焰，准备焚烧方济各。方济各坦然准备从火中走过。这也是一个表现方济各神圣性的传说。
Legend of St Francis：12. Ecstasy of St Francis，1297-1300，270x230cm，Upper Church, San Francesco, Assisi
12.圣方济各的喜悦耶稣出现在了圣方济各面前，他喜悦的心情溢于言表。
Legend of St Francis：13. Institution of the Crib at Greccio，1300，Upper Church, San Francesco, Assisi
13.方济各接生跪在前排的头上有光环的是圣方济各。他正在给还是婴儿的耶稣准备一只有围栏的小床。在圣坛的墙外，许多妇女急于想看到那张小床；左右各站着两名修道士，四个人一起开口唱起了赞美诗。
Legend of St Francis：14. Miracle of the Spring，1297-1300，270x230cm，Upper Church, San Francesco, Assisi
14.泉水的奇迹天气干旱，农民很久都没有水喝，圣方济各虔诚地向上天祈祷。仿佛听到了他的呼声，水开始从石头里不停地涌出来，画面右下方饥渴的农民俯身喝水。
Legend of St Francis：15. Sermon to the Birds，1297-99，270x230cm，Upper Church, San Francesco, Assisi
15.向鸟儿布道圣方济各在行走途中遇到了一群飞鸟。他像看待自己的兄弟一样看待这些小生物，因此方济各开始对他们布道。鸟儿们仿佛回应他的宣讲，纷纷聚集在地上一动不动，直到这场布道结束才离开。画家乔托通过方济各背后修士的表情和动作来突出这个事件的神圣性和不可思议。
Legend of St Francis：16. Death of the Knight of Celano，1297-1300，Upper Church, San Francesco, Assisi
16.骑士之死方济各对一位即将离世的骑士送出祝福。
Legend of St Francis：17. St Francis Preaching before Honorius III，1300，Upper Church, San Francesco, Assisi
17.圣弗朗西斯在霍诺留三世面前宣讲方济各被教皇霍诺留召见，他即兴发挥的精彩演讲震动了教皇和他身边的侍从们。他们仿佛聆听到了上帝的话语。我们可以仔细观察画面中每个人生动的面部表情，尤其是教皇用手托住下巴，似乎所有所思的样子。
Legend of St Francis：18. Apparition at Arles，1297-1300，270x230cm，Upper Church, San Francesco, Assisi
18.在阿尔勒的显圣来自帕多瓦的圣安东尼（另外一位圣人）在向自己的信徒布道，突然方济各显圣出现在了众人面前。他双手张开，表明了他是像耶稣一样的神圣者，圣安东尼看向显圣的方济各，显得有些惊奇。
放大的圣安东尼特写
Legend of St Francis：19. Stigmatization of St Francis，1297-1300，Upper Church, San Francesco, Assisi
19.圣方济各接受圣痕在与世隔绝的群山中，方济各长时间独自苦修。耶稣被天使的翅膀包裹着出现在了这位修士面前，用金色的光辉照射方济各。方济各的身上随之出现了和耶稣一模一样的伤痕，被称为圣痕。方济各也是很少的几个罗马教会承认身有圣痕的圣人，这标志着他的崇高地位。
Legend of St Francis：22. Verification of the Stigmata，1300，270x230cm，Upper Church, San Francesco, Assisi
22.圣痕鉴定在方济各去世后，人们在他身上发现了和耶稣一模一样的圣痕。教廷派人前来鉴定，也确认了他的神圣身份。
Legend of St Francis：23. St. Francis Mourned by St. Clare，1300，270x230cm，Upper Church, San Francesco, Assisi
23.圣嘉勒哀悼圣方济各圣嘉勒是圣方济各的同乡。她被方济各的精神所感召，投入到基督教苦修事业中，创立了女性修道会，在方济各去世后，她因为失去了一位伟大的导师而痛苦不堪，。
Legend of St Francis：24. Canonization of St Francis，1300，270x230cm，Upper Church, San Francesco, Assisi
24.圣方济各封圣这幅画已经有些不太清楚了，教皇亲自为方济各主持了葬礼，并宣布他为圣人，将永远成为基督教徒信仰追随的偶像。
以上这些就是阿西西上教堂壁画，全部由著名艺术家乔托所创作。乔托的伟大意义在于他从某种程度上摆脱了死板枯燥的中世纪画风，开始用自己的方式诠释方济各的故事。这种画法引领了潮流，当每个画家都开始用自己的风格而不是教会规定的方式来诠释艺术作品时，文艺复兴就开始了。达芬奇、米开朗基罗和拉斐尔的伟大杰作随之而来。
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