一、孔氏首次披露信息引发猜测
2016年2月的《人类学学报》上发布了侯伟光等5人的文章《曲阜地区孔姓人群 17 个 Y-STR 基因座遗传多态性分析》，第一次展示了孔氏家族的DNA信息。
从该文公开的数据是极为丰富的，共计“1118 名男性个体 FTA 卡血样样本”，“均采自山东省曲阜地区”，孔氏家族存在C-M217和Q-M120两个显著集中的大家族。其中C2-M217占比46.06%、Q-M120占比27.01，该文作者认为“C3 和 Q1a1 都可能是孔子后裔的类型”。
论文用network软件绘制了C-M217和Q-M120的关系图，仅从network图看，C的分化历史明显更长，支系更多，已经形成多中心，Q的分化历史更短，有一个持续的强势中心。
由于两者共祖时间超过6万年，因此不可能同时来自2000 年前一个祖先，因此，孔子后裔是C-M217和Q-M120引起了猜测。
二、大数据信息中的C类型
对于孔氏家族的DNA，商业公司23魔方在大数据分析后，认为“在中国存在一个孔姓家族。中国的孔姓男性用户中 C-MF1915 占比是 4.95% 是中国正常水平 0.02% 的约 248 倍，且经过统计学检验，此家族非常显著。据此，我们推测 C-MF1915 下游可能存在一个人数众多的孔姓家族。”
从23魔方给出的分化图看，C-MF1920可以分为 3 支：
最大的一支C-MF1920-MF1922，共祖于1060年前，主要分布在山东，这一支系有很多孔姓网友已经公开所属家谱宗派，目前有内孔“60户”中的第43户“广文户”、第58户“息陬户”等，还有60户之外的成武支、阳城支等等，应该就是今天所谓孔氏“北宗”的支系类型；
第二个支系C-MF1920-MF66266，共祖于1000年前，目前分布于广东、四川，尚未发现这一支系的人员公开宗谱；
第三个支系为C-MF1920-MF37568，共祖于840年前，主要分布于浙江，目前也有这一支系网友公开了自己的家谱宗派，属于浙江衢州孔氏，即“南宗”。
从细化结果看，C-MF1920 这个支系对应在魏晋以来，在两宋有过一定增长，于明朝又有过一定发展的孔姓家族。
当然，对此不仅基因测序公司23魔方，学术界也有人认同这一观点，《Phylogenetic analysis of the Y-chromosome haplogroup C2b-F1067, a dominant paternal lineage in Eastern Eurasia》亦认为孔夫子家族属于C2-F1067，按照其标记的类型方式为Cα1b1b-F10056下游的Cα1b1b1a1a1a1a-MF1915。
三、大数据信息中的Q类型
对于孔氏家族的DNA，商业公司23魔方在大数据分析后，认为“在山东存在一个孔姓家族。山东的孔姓男性用户中 Q-F1626 占比是 12.07% 是山东正常水平 2.14% 的约 6 倍，且经过统计学检验，此家族非常显著。据此，我们推测 Q-F1626 下游可能存在一个人数众多的孔姓家族，这个家族的主要成员分布在山东地区。”
曲阜孔氏家族为Q-MF30796 ，Q-MF30796于870 年前（金朝/南宋）分为 3 支，其中 Q-MF32746 又于 450 年前（明朝中期）分为 2 支。从细化结果看，Q-MF30796 这个支系对应在金朝和明朝有过一定人口增长的孔姓家族。
从目前公开家谱宗派的网友看，属于这一支系的有“内孔60户”中的第1户“大宗户”、第5户“縢阳户”，以及迁移至台湾的部分孔姓网友（疑似大宗户，未证实），从谱系看，自宋仁宗公元1055年封“衍圣公”后，绝大部分时间，至少元代孔思晦以下的历代衍圣公均属于这一类型，从文化传承上，这一支系更代表了宗法。
四、C-MF1920和Q-MF30796在现代人中的分布
根据23魔方的数据，C-MF1920占现代中国男性的0.22%，绝大部分分布在汉族人中，占曲阜当地人口的6%.
Q-MF30796占现代汉族的0.003%，绝大部分分布在汉族人中，占曲阜当地人口也可达6%。
无论是C-F10056-MF1920还是Q-M120-MF30796，均为传统汉族Y染色体类型，在其他民族中数量极少。
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