在动画中我们发现其实灰原哀是跟阿笠博士睡一个屋，卧室跟个标间似的。他家看设定应该挺大的吧，给小哀腾个单人间问题不大吧，睡一屋怎么感觉怪怪的。而且阿笠博士呼噜打的震天响，都能把自己吵醒，这不会让人神经衰弱么。
所以问题来了，小哀跟阿笠博士到底什么关系？
阿笠博士是小哀的救命恩人，在灰原变小后要过来找新一的门口捡到。从阿笠博士在新一很小的时候就经常跟他玩，我们由此可以推断他很应该喜欢小孩子，有一颗童心。虽然一直单身，但对小孩非常和蔼，少年侦探团的孩子们常去他家玩耍，大家也常乘坐黄色古董甲壳虫轿车一同出门去旅行。所以阿笠博士收留小哀大概是因为一个人寂寞，希望有人陪他玩吧。至于伏笔方面，反正已经辟谣不是最终boss，所以往其他地方猜吧，至少是一个老好人吧。
而关于灰原哀，我们在看动画的时候都会觉得灰原博学多学（发明了APTX4869）、善于推理（经常与柯南一同推理）。思想始终令人捉摸不透，异常的冷静，看起来似乎很坚强，但其实内心却十分脆弱，硬撑着的外表下，只是一个能听到姐姐10秒的留言来感到温暖的寂寞的女孩。时刻担心的外界的危险，十分没有安全感，一个人的话会担心的睡不着，所以要求和博士睡一间吧。
表面上阿笠博士是灰原的监护人，但其实应该是反过来的。因为博士比较爱吃高卡的东西，但是哀君是个主攻生化的科学家，知道一个胖子吃这么多脂肪是不好的，所以不允许他吃，哀君属于三无和女王什么的，所以威慑力很大啦...
至于有人猜测其实阿笠博士就是灰原的真实父亲，就就纯属扯淡了，除非伦理错乱起来。这两个人表现上更像爷孙两，实际年纪也是相差蛮多，所以那些传阿笠博士和灰原绯闻的到底出于什么目的？
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