在明朝皇帝中，朱允炆的结局算是比较扑朔迷离的了，他的皇位由他的祖父朱元璋钦点，却得不到他亲叔叔朱棣的承认。在初登基的朱允炆的削藩政策下，朱棣终于举起造反的大旗，决定把自己的侄子拉下皇位，换自己坐。
这场历时四年的对峙，最终以朱棣踏进皇宫，朱允炆放了一把大火而结束，朱棣胜利了，朱允炆失败了，或者说，朱允炆的失败，原因虽有朱棣卓越的能力，却也有朱允炆的优柔寡断，若不是他屡次和将领说不可杀燕王，朱棣未必活的到最后。
朱允炆
一把大火，烧死了朱允炆的皇后，皇后在大火中自尽。然而关于朱允炆的去向，却成了一个谜。主要有三种说法。
一、自焚而死
朱棣登位后在给朝鲜国王的诏书上曰：“不期建文为权奸逼胁，阖宫自己焚燃“（《明实录·太宗实录》）。
朱棣对外一致说，朱允炆已经自焚而死，那把大火不仅烧死了皇后，也烧死了朱允炆，这是最官方的一种说法。
朱允炆
二、出家为僧
出家为僧也是一种比较普遍的说法，说是在朱棣打进皇宫以后，朱允炆通过朱元璋先前给他留下的救命通道，出了宫，此后感觉万念俱灰，于是选择出家，忘记一切。
在万历《钱塘县志·纪制》记载：“东明寺在安溪大遮山前，建文君为僧至此，有遗像“。（《杭县志稿》卷八）“相传朱允炆遁迹至此，时旭日始旦，题曰东明。自归国后，方知为帝。今范其遗像。有手植牡丹，色白如银“。明代嘉靖年间《留青日札摘抄》、清代康熙年间《湖堧杂记》中也都有记载。
和尚
三、逃出西洋
在《明史·姚广孝传》和《胡濙传》里记载：明成祖朱棣当了皇帝后，对朱允炆自焚而死，也产生过怀疑，也有人告诉他那具烧焦的尸体是马皇后的，朱允炆外逃了，可能逃到西洋了。他就把朱允炆的主录僧溥洽抓了起来关进监狱长达十余年，逼他供出朱允炆下落。并派郑和下西洋“欲寻踪迹“，没想到最后没有找到人，反而成就了一段海上传奇。
综上，朱棣在即位后，下令搜寻朱允炆，这是历史事实。朱允炆的真正下落，至今仍是一个未揭开的历史之谜。
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