金针菇属低温型菌类，菌丝生长适温为7～30℃，最佳23℃；子实体分化发育适温为3～18℃，以12～13℃生长最好。温度低于3℃菌盖会变成麦芽糖色，并出现畸形菇。南方栽培应在秋末冬初进行，北方应在秋季中前期进行，这样就可以充分利用自然温度，培养菌丝。待菌丝生理成熟后，天气渐冷，气温下降，正好适合子实体生长发育。
栽培配方1、棉籽壳100公斤、小麦麸皮20公斤、玉米面5公斤、石膏粉2公斤、过磷酸钙1公斤、白糖1公斤。 2、玉米芯75公斤、小麦麸皮20公斤、玉米面3.5公斤、石膏粉2公斤、黄豆面1.5公斤、过磷酸钙1公斤、白糖1公斤。 3、木屑40公斤，棉籽壳36公斤，小麦麸皮20公斤，糖、石膏、尿素和石灰各1公斤。 4、稻草或麦草50公斤，木屑22公斤，小麦麸皮25公斤，尿素、石膏、石灰各1公斤。
袋栽金针菇可选用聚丙烯或高密度聚乙烯塑料袋。袋的质量要好，厚薄均匀，能耐100～125℃高温。塑料袋规格：长35～45厘米、宽15～18厘米、厚0.4～0.6毫米。每袋装干料300～500克。 将料拌匀后，再闷2～4小时即可装袋。装袋时边装料边压实，装好后两端用细绳扎成活结。按常规方法进行高压或常压灭菌。灭菌后的料袋，冷却至室温后即可进行接种。接种箱按每立方米用甲醛10毫升、高锰酸钾5克进行灭菌30分钟。
接种时严格执行操作规程，在料袋两端接种，一般每瓶种（750克/瓶）可接种25～30袋。接种后及时将料袋移入培养室，在温度适宜的条件下，约24小时菌丝开始萌发，在20～25℃室温下生长40～50天即可满袋。9月中旬接种，大部分10月底发透菌丝，叫全期发菌。以后接种由于温度低，发菌半袋后便边爬料边出菇，叫做半期发菌出菇。
菌丝期管理接过菌的料袋要竖立在床架或地面，若是两端接种的长袋可卧放床架，一般叠放2～3层。培养室温度控制在20～25℃，空气湿度控制在70％以下，闭光培养。接种一周后应经常开通气孔通气，并翻动和倒换菌袋，以利于菌丝生长整齐一致。秋栽金针菇，在9～10月中旬接种后，气温还较高，应在早、晚开门窗通气散热，白天关闭门窗或通气孔阻止热空气进入。到11月份，当气温变凉时，白天可通气，晚上关闭保温。接种后30～35天，菌丝可长满袋。
催蕾
菌丝满袋后要及时搬到适温的栽培室，去掉棉花塞和套环，进行搔菌（即耙去老菌种块），再把塑料袋上端撑开成圆筒状，在袋口覆盖报纸或厚布，在覆盖物上喷水保湿。催蕾期间，栽培室的空气相对湿度要求在80％～90％。可采用细眼喷雾器，每天上、下午各喷水1次，要注意覆盖物上不能有积水，以防破损后水流进袋内，一旦发现袋内有积水时要及时倒掉。一周后培养基上部就会出现琥珀色的水滴，有时还会形成一层白色的棉状物，这是现蕾的前兆。这时要结合上、下午喷水打开覆盖物1～2小时，现蕾后，逐渐延长通气时间，促使菇蕾大量发生。一般原基发生快的菌株8～10天就会现蕾，慢的需12～15天才能现蕾。这时覆盖物上更不能有积水，也绝对不能让水喷到菇体上。菇蕾如果碰到水，菌柄基部就会变成黄褐色至咖啡色，严重的还会烂菇。催蕾好的袋子，整个培养基表面布满整齐、白色的菇蕾。 2.出菇：搔菌
要及时搔菌，可用搔菌耙或钩先把老菌种扒净，再将表面菌皮轻轻划破，但是不要划得太深。搔菌的作用是增加菌丝与空气接触，以刺激菌蕾形成，并使菌蕾发育整齐。搔菌的适宜时间是在菌丝体表面出现黄水珠时。搔菌后把薄膜袋拉直，排放在床架上或地面上，及时在袋口覆盖薄膜或报纸。
控温
温度要控制在10～12℃。如温度高于13℃，培养料表面往往会出现大量气生菌丝（白色的棉状物），影响菇蕾的形成。
出菇期管理
当菇柄长至1～3厘米时，菇棚温度降至8～10℃，停止喷水，湿度控制在80％～85％，加大通风量，每次通气时间0.5～1小时。增加散射光强度（可用40瓦的灯照射）。在以上条件下，管理3～5天，金针菇可缓慢长成健壮一致的菇丛。
生长期管理
生长期管理的目的是促使菌柄伸长，抑制菌盖生长。管理的措施是菇棚温度调至8～12℃，湿度控制在85％～90％。每天向地面和空间喷水增加湿度，结合喷水后揭膜通风20～30分钟，以80～100勒克斯光照强度照射，诱导菇丛整齐生长、不扭曲。遇高温天气，要减少喷水，加大通风量。菇棚通气和揭膜通气不要同时进行。一般是先菇棚通气，再揭膜通气，盖膜后再喷水。以上措施一直管理到采收。
采收及采收后管理当菇柄长10～15厘米、菌盖直径1厘米时，即可采收。 采收后，清理干净料面，挖去残菇和老菌皮，进行搔菌。搔菌后停止喷水3～5天进行养菌。养菌后每袋注入清水100～200克，浸1～2天，倒去多余水分。补水后暂不盖袋口，通风1～2次，使菌丝体表面稍干后，再盖膜催蕾进行第二茬商品菇的管理。约经15～20天，又可采收第二茬商品菇。
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