该校9个学科进入ESI全球前1%，拥有5个一级学科国家重点学科和9个二级学科国家重点学科（涵盖38个二级国家重点学科），46个福建省一级学科重点学科，9个国家基础科学人才培养基地。拥有31个博士后流动站，31个博士学位授权一级学科，50个硕士学位授权一级学科，8个交叉学科专业授权点；22个专业学位授权点。
福建师范大学
学校拥有国家重点学科1个、省高校优势学科创新平台（含培育）3个、省特色重点学科9个、省重点学科26个，博士后科研流动站19个，博士学位授权一级学科19个,硕士学位授权一级学科37个，硕士专业学位授权点13个，还拥有高校、中职教师在职攻读硕士学位授权点。6个学科在全国第三轮学科评估中进入全国同类学科前20名，其中3个学科进入全国同类学科前10名。化学学科进入ESI全球排名前1% 。
福州大学
学校有国家重点学科1个（物理化学）、国福州大学.旗山校区夜景家级重点（培育）学科1个（结构工程）、省级优势学科创新平台5个、省级特色重点学科6个、省级重点学科26个；化学、工程学和材料科学3个学科进入国际ESI学科排名前1%。
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