免疫器官包括胸腺、骨髓 、淋巴结及脾。
1. 胸腺
是促进T淋巴细胞成熟及分化的重要器官。出生时仅重10g，2~5岁时为25g, 6~11岁为30g，以后渐萎缩。若出生时无胸腺或胸腺发育不良，可发生先天性免疫缺陷性疾病。
2. 骨髓
为造血组织，骨髓中的多能干细胞可分化为原始造血细胞、淋巴干细胞，并能形成淋巴细胞。
临床上可以利用骨髓移植术，治疗小儿先天性免疫缺陷性疾病或白血病。
3. 淋巴结
小儿淋巴系统出生时发育尚未成熟，故新生儿不易摸到淋巴结，至1岁以后大多均能触及，约0.5cm大小，以后发育较快,12~13岁发育成熟，而后淋巴结逐渐缩小，至青春期发育停止。
淋巴结的主要功能是产生淋巴细胞，为身体的防御屏障。淋巴结还有过滤、吞噬抗原及细菌的作用，并能防止疾病的蔓延。
4. 脾
由红髓和白髓两部分组成。白髓为T淋巴细胞的集中区域，而B淋巴细胞的储藏地位于髓索。其主要功能为促进吞噬细胞的吞噬作用，合成备解素，杀灭某些细菌及病毒。
5.另外一个免疫系统
另外，也有一些学者认为，人的皮肤、口腔粘膜，肠道粘膜及肠道菌群是人体的另外一个免疫系统，其免疫作用十分强大。我们期待着对这个免疫系统的研究有更大的突破。
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